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Enregistrement W4324128917 · doi:10.15252/emmm.202216834

Bi‐allelic mutation in SEC16B alters collagen trafficking and increases ER stress

2023· article· en· W4324128917 sur OpenAlexaff
Ahmed El‐Gazzar, Barbara Voraberger, Frank Rauch, Mario Mairhofer, Katy Schmidt, Brecht Guillemyn, Goran Mitulović, Veronika Reiterer, Margot Haun, Michaela M Mayr, Johannes A. Mayr, Susanne Kimeswenger, Oliver Drews, Vrinda Saraff, Nick Shaw, Nadja Fratzl‐Zelman, Sofie Symoens, Hesso Farhan, Wolfgang Högler

Notice bibliographique

RevueEMBO Molecular Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensMcGill UniversityShriners Hospitals for Children - Canada
Organismes subventionnairesAllgemeine UnfallversicherungsanstaltUniversity of WashingtonFred Hutchinson Cancer Research Center
Mots-clésOsteogenesis imperfectaMissense mutationCell biologyType I collagenMutationGolgi apparatusChemistryBiologyEndocrinologyEndoplasmic reticulumGeneticsGeneAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Osteogenesis imperfecta (OI) is a genetically and clinically heterogeneous disorder characterized by bone fragility and reduced bone mass generally caused by defects in type I collagen structure or defects in proteins interacting with collagen processing. We identified a homozygous missense mutation in SEC16B in a child with vertebral fractures, leg bowing, short stature, muscular hypotonia, and bone densitometric and histomorphometric features in keeping with OI with distinct ultrastructural features. In line with the putative function of SEC16B as a regulator of trafficking between the ER and the Golgi complex, we showed that patient fibroblasts accumulated type I procollagen in the ER and exhibited a general trafficking defect at the level of the ER. Consequently, patient fibroblasts exhibited ER stress, enhanced autophagosome formation, and higher levels of apoptosis. Transfection of wild-type SEC16B into patient cells rescued the collagen trafficking. Mechanistically, we show that the defect is a consequence of reduced SEC16B expression, rather than due to alterations in protein function. These data suggest SEC16B as a recessive candidate gene for OI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,414
Score d'incertitude au seuil0,571

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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