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Enregistrement W4324132784 · doi:10.1021/acsmedchemlett.2c00530

Discovery of a Potent and Selective Naphthyridine-Based Chemical Probe for Casein Kinase 2

2023· article· en· W4324132784 sur OpenAlexfundno aff
Zachary W. Davis‐Gilbert, Andreas Krämer, James E. Dunford, Stefanie Howell, Filiz Senbabaoglu, Carrow I. Wells, Frances M. Bashore, Tammy M. Havener, Jeffery L. Smith, Mohammad Anwar Hossain, Udo Oppermann, David H. Drewry, Alison D. Axtman

Notice bibliographique

RevueACS Medicinal Chemistry Letters · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEshelman Institute for Innovation, University of North Carolina at Chapel HillNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesGenentechInnovative Medicines InitiativeCancer Research UKCanada Foundation for InnovationOntario Genomics InstituteEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsFondation LeducqMerck KGaANational Institutes of HealthOntario GenomicsFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloGenome CanadaU.S. Department of DefenseChordoma FoundationPfizerFundação Amazônia Paraense de Amparo à PesquisaMcGill UniversityNorth Carolina Biotechnology CenterBayer
Mots-clésCasein kinase 2KinomeChemical biologySmall moleculeChemistrySelectivityDrug discoveryKinaseCombinatorial chemistryBiochemistryComputational biologyProtein kinase ABiologyMitogen-activated protein kinase kinase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Naphthyridine-based inhibitors were synthesized to yield a potent and cell-active inhibitor of casein kinase 2 (CK2). Compound 2 selectively inhibits CK2α and CK2α′ when profiled broadly, thereby making it an exquisitely selective chemical probe for CK2. A negative control that is structurally related but lacks a key hinge-binding nitrogen ( 7 ) was designed on the basis of structural studies. Compound 7 does not bind CK2α or CK2α′ in cells and demonstrates excellent kinome-wide selectivity. Differential anticancer activity was observed when compound 2 was profiled alongside a structurally distinct CK2 chemical probe: SGC-CK2-1. This naphthyridine-based chemical probe ( 2 ) represents one of the best available small molecule tools with which to interrogate biology mediated by CK2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,613

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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