Abstract P240: Higher Body Mass Index is Associated With Lower Placental Expression of EPYC: Results From a Genome-Wide Transcriptomic Study in the Gen3G Cohort
Notice bibliographique
Résumé
Background: Elevated maternal body mass index (BMI) in pregnancy is associated with adverse maternal and fetal outcomes. Identification of alterations in the placental transcriptome may elucidate molecular markers of the biological pathways underlying these associations. Methods: We investigated the association of first trimester maternal BMI with the placental transcriptome in Gen3G, a large population-based pregnancy cohort. We completed RNA sequencing of 449 placental samples and performed differential gene expression analysis of over 15,000 genes (Limma Voom). We used maternal BMI as a continuous variable, with estimates reported as change in normalized gene expression per 1-unit increase in BMI (kg/m2), as well as a categorical variable (participants with normal weight (N=270) vs. obesity (N=82)), with RNA expression estimates reported as log2 fold changes. We adjusted models for maternal age, fetal sex, gestational age and 6 surrogate variables inferred from the expression data to adjust for batch effects and other unmeasured sources of variability. We accounted for multiple testing using False Discovery Rate (FDR). Sensitivity analyses were performed by removing cases of gestational diabetes and hypertensive disorders in pregnancy. Results: At enrollment in early pregnancy, participants had a mean ± SD age of 28.2 ± 4.4 years and measured BMI of 25.4 ± 5.5 kg/m 2 ; 57% of participants were categorized in normal weight, 22% in overweight and 18% in obesity BMI categories. Maternal BMI was significantly associated with decreased expression of EPYC , a gene that regulates fibrillogenesis (slope= -0.14, FDR-adjusted P=1.68x10 -5 for continuous BMI; log2 fold change= -1.71, FDR-adjusted P=1.06x10 -2 for obesity vs. normal weight). Both sensitivity analyses with the removal of gestational diabetes and hypertensive disorders revealed similar associations for EPYC . Conclusions: We identified an association between elevated maternal BMI and downregulation of EPYC expression in the placenta. Additional studies are required to examine the role of placental EPYC expression in maternal and fetal health.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».