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Enregistrement W4324141484 · doi:10.3390/pathogens12030454

Impact of Infection with Flavobacterium psychrophilum and Antimicrobial Treatment on the Intestinal Microbiota of Rainbow Trout

2023· article· en· W4324141484 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePathogens · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural Affairs
Mots-clésFlorfenicolBiologyMicrobiologyRainbow troutErythromycinFlavobacteriumTroutAeromonasAntibioticsProteobacteria16S ribosomal RNABacteriaPseudomonasFish <Actinopterygii>Fishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The diversity and composition of intestinal microbiota in rainbow trout have been studied using next-generation sequencing (NGS), although few studies have examined the effects of antimicrobials. We evaluated the effect of antibiotics florfenicol and erythromycin and infection with or without Flavobacterium psychrophilum on the intestinal microbiota in rainbow trout juveniles (30–40 g) using NGS. Prophylactic oral antibiotic treatments were administered for 10 days before groups of fish were injected intraperitoneally with virulent F. psychrophilum. Intestinal content (allochthonous bacteria) was collected at day −11, 0, 12, and 24 p.i., and the v3–v4 region of the 16S rRNA gene was sequenced using Illumina MiSeq. Before prophylactic treatment, Tenericutes and Proteobacteria were the most abundant phyla identified and Mycoplasma was the most abundant genus. Fish infected with F. psychrophilum had decreased alpha diversity and a high abundance of Mycoplasma. Fish administered florfenicol had increased alpha diversity compared to the control at day 24 p.i., although both florfenicol and erythromycin-treated fish had a higher abundance of potential pathogens, specifically Aeromonas, Pseudomonas, and Acinetobacter. Mycoplasma disappeared after treatment but appeared again after day 24. This study demonstrates that prophylactic oral treatment with antibiotics florfenicol and erythromycin as well as F. psychrophilum infection changed the composition of intestinal microbiota in rainbow trout juveniles that did not recover by day 24 p.i. and further long-term effects on the host need to be investigated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,601
Score d'incertitude au seuil0,471

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle