MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4324145785 · doi:10.3389/fimmu.2023.1110292

Immunologic risk stratification of pediatric heart transplant patients by combining HLA-EMMA and PIRCHE-II

2023· article· en· W4324145785 sur OpenAlexaff
Mitchell A. Ellison, Massimo Mangiola, Marilyn Marrari, Carol Bentlejewski, J. Sadowski, Dwayne Zern, Cynthia S. M. Kramer, Sebastiaan Heidt, Matthias Niemann, Qingyong Xu, Anne I. Dipchand, William T. Mahle, J. W. Rossano, Charles E. Canter, Tajinder P. Singh, Warren A. Zuckerman, Daphne T. Hsu, Brian Feingold, Steve Webber, Adriana Zeevi

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTransplantation: Methods and Outcomes
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésHuman leukocyte antigenMedicineHeart transplantationTransplantationRisk stratificationImmunosuppressionEpitopeBiomarkerPopulationImmunologyGenotypingPanel reactive antibodyInternal medicineAntibodyAntigenGenotypeBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human leukocyte antigen (HLA) molecular mismatch is a powerful biomarker of rejection. Few studies have explored its use in assessing rejection risk in heart transplant recipients. We tested the hypothesis that a combination of HLA Epitope Mismatch Algorithm (HLA-EMMA) and Predicted Indirectly Recognizable HLA Epitopes (PIRCHE-II) algorithms can improve risk stratification of pediatric heart transplant recipients. Class I and II HLA genotyping were performed by next-generation sequencing on 274 recipient/donor pairs enrolled in the Clinical Trials in Organ Transplantation in Children (CTOTC). Using high-resolution genotypes, we performed HLA molecular mismatch analysis with HLA-EMMA and PIRCHE-II, and correlated these findings with clinical outcomes. Patients without pre-formed donor specific antibody (DSA) (n=100) were used for correlations with post-transplant DSA and antibody mediated rejection (ABMR). Risk cut-offs were determined for DSA and ABMR using both algorithms. HLA-EMMA cut-offs alone predict the risk of DSA and ABMR; however, if used in combination with PIRCHE-II, the population could be further stratified into low-, intermediate-, and high-risk groups. The combination of HLA-EMMA and PIRCHE-II enables more granular immunological risk stratification. Intermediate-risk cases, like low-risk cases, are at a lower risk of DSA and ABMR. This new way of risk evaluation may facilitate individualized immunosuppression and surveillance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,529

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in ImmunologyMême sujetTransplantation: Methods and OutcomesTravaux en français237 207