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Enregistrement W4324346847 · doi:10.1261/rna.079555.122

Phosphorylation controls the oligomeric state of She2 and mRNA localization in yeast

2023· article· en· W4324346847 sur OpenAlexafffund
Nastaran Farajzadeh, Karen Shahbabian, Yani Bouaziz, Emmanuelle Querido, Pascal Chartrand

Notice bibliographique

RevueRNA · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité de MontréalInstitut de Recherche Clinique De Montréal
Mots-clésBiologyMessenger RNACell biologyPhosphorylationRNA-binding proteinRNAMolecular biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Messenger RNA (mRNA) localization is an important mechanism controlling local protein synthesis. In budding yeast, asymmetric localization of transcripts such as ASH1 mRNA to the bud tip depends on the She2 RNA-binding protein. She2 assembles as a tetramer to bind RNA, but the regulation of this process as part of the mRNA locasome is still unclear. Here, we performed a phosphoproteomic analysis of She2 in vivo and identified new phosphosites, several of which are located at the dimerization or tetramerization interfaces of She2. Remarkably, phosphomimetic mutations at these residues disrupt the capacity of She2 to promote Ash1 asymmetric accumulation. A detailed analysis of one of these residues, T109, shows that a T109D mutation inhibits She2 oligomerization and its interaction with She3 and the importin-α Srp1. She2 proteins harboring the T109D mutation also display reduced expression. More importantly, this phosphomimetic mutation strongly impairs the capacity of She2 to bind RNA and disrupts ASH1 mRNA localization. These results demonstrate that the control of She2 oligomerization by phosphorylation constitutes an important regulatory step in the mRNA localization pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,105
Score d'incertitude au seuil0,123

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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