Impact of <i>Helicobacter pylori</i> on the gastric microbiome in patients with chronic gastritis: a systematic review and meta-analysis protocol
Notice bibliographique
Résumé
Introduction Chronic gastritis is a common disease worldwide. Studies have consistently shown that chronic gastritis is usually associated with gastric microbial dysbiosis, especially the infection of Helicobacter pylori . However, the interaction between H. pylori and non- H. pylori bacteria in patients with chronic gastritis has not been clearly identified yet. Consequently, we designed a protocol for a systematic review and meta-analysis, which focused on identifying the changes in gastrointestinal microbiota composition between patients with H. pylori -infective and non-infective chronic gastritis. Method and analysis We will search PubMed, EMBASE and Cochrane Library databases to retrieve observational studies on humans. The eligible studies must include data about the relative abundance of the gastrointestinal microbiome in patients with H. pylori -infective or non-infective chronic gastritis. Only the data of adults aged over 18 years will be analysed. Two researchers will extract the data independently, and Newcastle–Ottawa Scale will be used to assess the risk of bias. Random-effects model will be performed in quantitative analyses. Correlation analysis, bioinformatics analysis and function analysis will be performed. Discussion Currently, numerous studies have revealed the role of H. pylori in chronic gastritis. However, the alterations of non- H. pylori bacteria in patients with chronic gastritis remain an open question. The results of our study might provide new insights into future diagnosis and treatments. Ethics and dissemination This study is based on published documents, unrelated to personal data, so ethical approval is not in need. The results of this study are expected to be published in journals or conference proceedings. PROSPERO registration number CRD42020205260; Pre-results.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,071 | 0,103 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,006 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,025 | 0,027 |
| Bibliométrie | 0,015 | 0,013 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,004 |
| Communication savante | 0,007 | 0,006 |
| Science ouverte | 0,006 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,007 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,045 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».