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Enregistrement W4327683979 · doi:10.1038/s41598-023-31239-x

Polyamine-mediated mechanisms contribute to oxidative stress tolerance in Pseudomonas syringae

2023· article· en· W4327683979 sur OpenAlexfundno aff
Leandro Solmi, Franco R. Rossi, Fernando Matías Romero, Marcel Bach‐Pages, Gail M. Preston, Oscar A. Ruiz, Andrés Gárriz

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePolyamine Metabolism and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilUniversity of British ColumbiaDirectorate for Biological SciencesUniversity of OxfordAgencia Nacional de Promoción Científica y TecnológicaConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y TécnicasSamuel Roberts Noble Foundation
Mots-clésSpermidinePolyaminePutrescinePseudomonas syringaeAgmatineOrnithine decarboxylaseBiochemistryOxidative stressProlineOxidative phosphorylationBacteriaBiologyOrnithineErwiniaChemistryArginineEnzymeAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Bacterial phytopathogens living on the surface or within plant tissues may experience oxidative stress because of the triggered plant defense responses. Although it has been suggested that polyamines can defend bacteria from this stress, the mechanism behind this action is not entirely understood. In this study, we investigated the effects of oxidative stress on the polyamine homeostasis of the plant pathogen Pseudomonas syringae and the functions of these compounds in bacterial stress tolerance. We demonstrated that bacteria respond to H 2 O 2 by increasing the external levels of the polyamine putrescine while maintaining the inner concentrations of this compound as well as the analogue amine spermidine. In line with this, adding exogenous putrescine to media increased bacterial tolerance to H 2 O 2 . Deletion of arginine decarboxylase ( speA ) and ornithine decarboxylate ( speC ), prevented the synthesis of putrescine and augmented susceptibility to H 2 O 2 , whereas targeting spermidine synthesis alone through deletion of spermidine synthase ( speE ) increased the level of extracellular putrescine and enhanced H 2 O 2 tolerance. Further research demonstrated that the increased tolerance of the Δs peE mutant correlated with higher expression of H 2 O 2 -degrading catalases and enhanced outer cell membrane stability. Thus, this work demonstrates previously unrecognized connections between bacterial defense mechanisms against oxidative stress and the polyamine metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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