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Enregistrement W4327710966 · doi:10.14785/lymphosign-2023-0002

A novel <i>STAT3</i> splice-site variant in a kindred with autosomal dominant hyper IgE syndrome

2023· article· en· W4327710966 sur OpenAlexaffvenue
Ori Scott, Marina Sham, Laura Abrego Fuentes, Myra Pereira, Daniele Merico, Vy H.D. Kim

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSplice site mutationExonspliceBiologyProbandMutationGeneticsRNA splicingImmunologyGeneAlternative splicingRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Dominant negative STAT3 loss-of-function is the most common genetic cause of hyper-IgE syndrome (HIES). Patients may present with a host of both immune and non-immune manifestations, including connective tissue abnormalities, recurrent infections, malignant predisposition, and biochemical evidence of elevated serum IgE or eosinophilia. Aim: To describe a novel splice-site variant in STAT3 resulting in HIES. Methods: Case report of two family members with HIES. Results: A proband and his son presented with neonatal-onset pustular rash, recurrent skin and sinopulmonary infections and elevated serum IgE and were diagnosed with AD-HIES. They were identified to harbor a novel splice-site variant in the DNA-binding domain (DBD) of STAT3: c.1110-3C>G, predicted to result in defective splicing in exon 12. Interestingly, a number of other patients with AD-HIES have mutations affecting the same splice-site, suggesting this may be a hot-spot for mutagenesis. Conclusion: Splice-site mutations in the DBD of STAT3 are increasingly identified as a cause of AD-HIES. Future work is required to delineate whether patients with splice-site mutations have unique clinical characteristics, supporting efforts for genotype-phenotype correlation in this disease. Statement of Novelty: We present a novel splice-site mutation in the DNA-binding domain of STAT3 leading to autosomal dominant hyper-IgE syndrome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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