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Enregistrement W4327814778 · doi:10.1111/1365-2435.14316

Measuring functional redundancy using generalized Hill numbers

2023· article· en· W4327814778 sur OpenAlexaff
Daniel Dick

Notice bibliographique

RevueFunctional Ecology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensTed Rogers Centre for Heart ResearchCollege of Family Physicians of CanadaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRedundancy (engineering)BiologyTaxonComputer scienceEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A number of metrics for quantifying the amount of functional redundancy in a community have been proposed over the years. Two of the most popular metrics are based on comparing a taxonomic diversity measure with a generalized form of the same measure that accounts for functional dissimilarities between taxa. These two metrics express redundancy as either an absolute or relative difference between the taxonomic diversity measure and its generalized form. Because they express the amount of redundancy in a community in terms of raw diversity values, both redundancy metrics are susceptible to the same issues that complicate the interpretation of most commonly used diversity indices. It is possible to overcome these issues by restating these two indices using a Hill numbers framework. As a growing number of authors have noted, these modified metrics provide a more intuitive quantitative definition of functional redundancy when used to rank communities. Beyond this intuitive definition, measuring redundancy in terms of Hill numbers allows researchers to control the influence of rare taxa on the output value, enabling ecologists to better predict how a community is expected to respond when exposed to an external perturbation that selectively eliminates rare or common taxa. Here I show that, of the two possible Hill number‐based redundancy metrics, the form based on a popular absolute redundancy metric is extremely sensitive to differences in taxonomic diversity and can provide a misleading picture of how much redundancy is present in a community. For this reason, I argue that Hill number‐based functional redundancy should be quantified using a relative metric that explicitly accounts for differences in effective taxonomic diversity. The proposed Hill number‐based relative redundancy measure is shown to provide a much more complete picture of the distribution of redundant taxa within a community, highlighting subtle patterns that are completely missed by the Hill number‐based absolute redundancy metric. I include open‐source R code for calculating the indices discussed here. Read the free Plain Language Summary for this article on the Journal blog.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,564
Score d'incertitude au seuil0,986

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2680,015

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,120
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,137 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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