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Enregistrement W4328025114 · doi:10.1055/s-0042-1759920

Spatio-temporal mathematical model describing the interplay between biomechanics and cell kinetics during fibrotic scar formation

2023· article· en· W4328025114 sur OpenAlexaff
Jieling Zhao, Seddik Hammad, Mathieu de Langlard, Pia Erdoesi, Yueni Li, Paul Van Liedekerke, Andreas Buttenschoen, Niels Grabe, Jan G. Hengstler, Matthias P. Ebert, Steven Dooley, Dirk Drasdo

Notice bibliographique

RevueZeitschrift für Gastroenterologie · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver physiology and pathology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExtracellular matrixFibrosisRegeneration (biology)HistopathologyPathologyCollagen fiberIn silicoBiophysicsCell biologyChemistryBiologyMedicineAnatomyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Liver fibrosis is characterized by the accumulation of overexpressed extracellular matrix (ECM) proteins as a result of exposure of tissue to repeated damage. There are distinct patterns of fibrosis such as collagen septa (from tissue sections called “fibrotic walls”) connecting two central veins due to toxic injury. In the past decade, some computational models using either rule-based models 2D or partial differential equations of liver fibrosis to study the cellular and molecular mechanisms. Within a 3D single-cell-based model resolving tissue microarchitecture, we now incorporate the collagen fiber mechanics to address fibrosis formation. The same model approach already simulated regeneration after acute liver damage hence fibrosis formation is a further step towards a digital liver twin. The pattern-characterizing parameters in this study were obtained through image analysis of images from animal experiments that were compared to human histopathology. We explored alternative model mechanisms and parameters for a detailed in silico study of possible mechanism on the formation of characteristic fibrotic walls in liver fibrosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,623
Score d'incertitude au seuil0,590

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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