CXCL1 and CXCL6 Are Potential Predictors for HCC Response to TACE
Notice bibliographique
Résumé
Distinct immune patterns of hepatocellular carcinoma (HCC) may have prognostic implications in the response to transarterial chemoembolization (TACE). Thus, we aimed to exploratively analyze tumor tissue of HCC patients who do or do not respond to TACE, and to identify novel prognostic biomarkers predictive of response to TACE. We retrospectively included 15 HCC patients who had three consecutive TACE between January 2019 and November 2019. Eight patients had a response while seven patients had no response to TACE. All patients had measurable disease according to mRECIST. Corresponding tumor tissue samples were processed for differential expression profiling using NanoString nCounter® PanCancer immune profiling panel. Immune-related pathways were broadly upregulated in TACE responders. The top differentially regulated genes were the upregulated CXCL1 (log2fc 4.98, Benjamini–Hochberg (BH)-p < 0.001), CXCL6 (log2fc 4.43, BH-p = 0.016) and the downregulated MME (log2fc −4.33, BH-p 0.001). CD8/T-regs was highly increased in responders, whereas the relative number of T-regs to tumor-infiltrating lymphocytes (TIL) was highly decreased. We preliminary identified CXCL1 and CXCL6 as candidate genes that might have the potential to serve as therapeutically relevant biomarkers in HCC patients. This might pave the way to improve patient selection for TACE in HCC patients beyond expert consensus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».