The RNA binding protein KSRP negatively regulates utrophin A expression in skeletal muscle
Notice bibliographique
Résumé
mRNA stability is a key factor in determining the expression pattern of many genes and typically involves sequences in the 3′UTR and RNA-binding proteins (RBPs). We have previously identified regions in utrophin A transcripts important to regulate their stability via a conserved AU-rich element (Chakkalakal JV et al, Nucl. Acid Res., 2008). The purpose of the present study was to assess the effects of the RBP KSRP on expression of utrophin in muscle. Our data demonstrate that shRNA-mediated knockdown of KSRP in myoblasts caused a 2-fold increase in the expression of a reporter construct containing the utrophin 3′UTR. Moreover, a 3-fold increase in endogenous utrophin transcript and protein levels was apparent upon KSRP suppression. To demonstrate a physical association between KSRP and utrophin mRNAs, we performed RNA-immunoprecipitation (RIP) analyses using C2C12 cell and TA muscle extracts and an anti-KSRP anitodoby. RIP analysis revealed that utrophin A mRNA was targeted by KSRP in vitro and in vivo. Furthermore, co-electroporation of murine TA muscle with sh-KSRP and the utrophin A 3′UTR reporter construct resulted in an elevation of reporter activity. This was accompanied by an increase in endogenous utrophin expression. Together, these data demonstrate that KSRP negatively regulates the stability of utrophin A mRNA via its 3′UTR. Supported by CIHR, AFM (France) and MDA (USA).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».