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Enregistrement W4353020444 · doi:10.1371/journal.pone.0282794

Spatiotemporal transitions in Pseudo-nitzschia species assemblages and domoic acid along the Alaska coast

2023· article· en· W4353020444 sur OpenAlexaff
Katherine A. Hubbard, Maria Célia Villac, Christina Chadwick, Alexandra A. DeSmidt, Leanne J. Flewelling, April A. Granholm, Molly Joseph, Taylor Wood, Evangeline Fachon, Michael L. Brosnahan, Mindy L. Richlen, Mrunmayee Pathare, Dean A. Stockwell, Peigen Lin, Josée N. Bouchard, Robert S. Pickart, Donald M. Anderson

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine Toxins and Detection Methods
Établissements canadiensCentre de Recherche sur les Biotechnologies Marines
Organismes subventionnairesNational Centers for Coastal Ocean ScienceOffice of Polar ProgramsNational Institute of Environmental Health SciencesCooperative Institute for the North Atlantic RegionNational Oceanic and Atmospheric AdministrationNational Science Foundation
Mots-clésDomoic acidOceanographyFisheryBiologyGeographyEcologyGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The toxic diatom genus Pseudo-nitzschia is distributed from equatorial to polar regions and is comprised of >57 species, some capable of producing the neurotoxin domoic acid (DA). In the Pacific Arctic Region spanning the Bering, Chukchi, and Beaufort seas, DA is recognized as an emerging human and ecosystem health threat, yet little is known about the composition and distribution of Pseudo-nitzschia species in these waters. This investigation characterized Pseudo-nitzschia assemblages in samples collected in 2018 during summer (August) and fall (October-November) surveys as part of the Distributed Biological Observatory and Arctic Observing Network, encompassing a broad geographic range (57.8° to 73.0°N, -138.9° to -169.9°W) and spanning temperature (-1.79 to 11.7°C) and salinity (22.9 to 32.9) gradients associated with distinct water masses. Species were identified using a genus-specific Automated Ribosomal Intergenic Spacer Analysis (ARISA). Seventeen amplicons were observed; seven corresponded to temperate, sub-polar, or polar Pseudo-nitzschia species based on parallel sequencing efforts (P. arctica, P. delicatissima, P. granii, P. obtusa, P. pungens, and two genotypes of P. seriata), and one represented Fragilariopsis oceanica. During summer, particulate DA (pDA; 4.0 to 130.0 ng L-1) was observed in the Bering Strait and Chukchi Sea where P. obtusa was prevalent. In fall, pDA (3.3 to 111.8 ng L-1) occurred along the Beaufort Sea shelf coincident with one P. seriata genotype, and south of the Bering Strait in association with the other P. seriata genotype. Taxa were correlated with latitude, longitude, temperature, salinity, pDA, and/or chlorophyll a, and each had a distinct distribution pattern. The observation of DA in association with different species, seasons, geographic regions, and water masses underscores the significant risk of Amnesic Shellfish Poisoning (ASP) and DA-poisoning in Alaska waters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,217
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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