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Enregistrement W4360820048 · doi:10.1093/femspd/ftad003

The<i>Burkholderia contaminans</i>prevalent phenotypes as possible markers of poor clinical outcomes in chronic lung infection of children with cystic fibrosis

2023· article· en· W4360820048 sur OpenAlexaff
Beltina Léon, Claudia I. Prieto, Marisa Bettiol, Mariana Leguizamón, Virginia D ́Alessandro, Daniela Casco, Carolina Elena Vita, Cecilia Beatriz Fígoli, Cecilia Vescina, F. Rentería, Silvia T. Cardona, Alejandra Bosch

Notice bibliographique

RevuePathogens and Disease · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesFondo para la Investigación Científica y TecnológicaFacultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La PlataUniversidad Nacional de La PlataMinisterio de Ciencia, Tecnología e Innovación ProductivaUniversidad de CórdobaConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Mots-clésBurkholderia cepacia complexBiologyChronic infectionBurkholderiaPhenotypeMicrobiologyPseudomonas aeruginosaPopulationGenotypeImmunologyCystic fibrosisMedicineGeneticsBacteriaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Burkholderia contaminans, a species of the Burkholderia cepacia complex-prevalent in certain Latin-American and European countries-can cause chronic pulmonary infection in persons with cystic fibrosis. Our aim was to gain insights into long-term lung infections with a focus on correlating how bacterial phenotypic traits in the chronic infection impact on patients' clinical outcome. Genotypic characteristics of 85 B. contaminans isolates recovered from 70 patients were investigated. For 16 of those patients, the clinical status and bacterial phenotypic characteristics, e.g. several virulence factors, phenotypic variants, and the antimicrobial susceptibility pattern, were evaluated. Two clones were found in the whole bacterial population: (i) the multiresistant ST 872 PCR-recA-RFLP-HaeIII-K-pattern clone, which carries a pathogenic island homologous to BcenGI11 of B. cenocepacia J2315, and (ii) the ST 102 PCR-recA-RFLP-HaeIII-AT-pattern clone. The emergence of certain bacterial phenotypes in the chronic infection such as the nonmucoid phenotype, small colony variants, brownish pigmented colonies, and hypermutators, proved to be, together with coinfection with Pseudomonas aeruginosa, the possible markers of more challenging infections and poor prognosis. The presence of cocolonizers and the bacterial phenotypes that are especially adapted to persist in long-term respiratory tract infections have a crucial role in patients' clinical outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,342

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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