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Enregistrement W4360874226 · doi:10.1016/j.ejca.2023.03.024

Molecular profiling and target actionability for precision medicine in neuroendocrine neoplasms: real-world data

2023· article· en· W4360874226 sur OpenAlexfundno aff
Alice Boilève, Matthieu Faron, Sarah Fodil-Cherif, Arnaud Bayle, Livia Lamartina, David Planchard, Lambros Tselikas, Christina Kanaan, Jean‐Yves Scoazec, Michel Ducreux, Antoîne Italiano, Éric Baudin, Julien Hadoux

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Cancer · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroendocrine Tumor Research Advances
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCilagChugai PharmaceuticalNovartis PharmaGenentechIpsenPharmaMarEisaiBasilea PharmaceuticaDaiichi Sankyo EuropeServierAstraZenecaNovocureInstitut National Du CancerEisai CanadaBeiGeneAgios PharmaceuticalsLoxo OncologyAstex PharmaceuticalsLes Laboratories Pierre FabrePfizerIncyteBoston PharmaceuticalsTaiho PharmaceuticalBayer HealthCareSanofiExelixisGlaxoSmithKlineRelay TherapeuticsAmgenCelgeneEli Lilly and CompanyBristol-Myers Squibb
Mots-clésNeuroendocrine tumorsMedicineMEN1EverolimusInternal medicineNeuroendocrine carcinomaPTENOncologyCarcinomaEndocrine system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Key molecular alterations (MA) of neuroendocrine neoplasm (NEN) of various grade/primaries have been described but the applicability of molecular profiling (MP) for precision medicine in NEN remains to be demonstrated. METHODS: We conducted a retrospective study of all patients with metastatic NEN who had MP on tumour tissue at Gustave Roussy. The primary objective was to assess the clinical applicability of MP by evaluating the growth modulator index (GMI) as the primary end-point. RESULTS: MPs were obtained in 114 out of 156 eligible patients, including 12% NET-G1, 42% NET-G2, 13% NET-G3 and 35% neuroendocrine carcinoma (NEC). Primary sites were lung/thymus (40%), pancreas (19%), gastro-intestinal (16%), head&neck (10%), unknown (10%) and others (10%) with synchronous metastases in 61% of the patients. Most frequent MA were: MEN1 (25%), PTEN (13%), TP53 (11%) and TSC2 (9%), in neuroendocrine tumour (NET), and TP53 (50%) and RB1 (18%) in NEC. ESMO Scale for Clinical Actionability of Molecular Targets (ESCAT) classification of these MA were: I(5%), III(20%), IV(23%), X(27%); a putative actionable MA was identified in 48% patients. Median TMB was 5.7 Mut/Mb, with 3 TMB > 10 and 1 MSI NET. No MA was found in 26% patients. Molecularly matched treatment was administered to 19 patients (4 NEC, 15 NET): immunotherapy (n = 3), tipifarnib (n = 1), NOTCHi (n = 1), EGFRi (n = 2), HER2i (n = 1) and everolimus (n = 11). Overall, 67% of patients had a clinical benefit defined as a GMI over 1.3 with a 78% disease control rate. CONCLUSION: We report 48% of NEN with a putative actionable MA of which 35% received molecularly matched treatment, with a clinical benefit in 67% of the cases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,303
Score d'incertitude au seuil0,463

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,417
Écart entre enseignants0,345 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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