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Enregistrement W4361010925 · doi:10.1016/j.xcrm.2023.101017

Robust SARS-CoV-2 T cell responses with common TCRαβ motifs toward COVID-19 vaccines in patients with hematological malignancy impacting B cells

2023· article· en· W4361010925 sur OpenAlexaff
Thi H. O. Nguyen, Louise C. Rowntree, Lilith F. Allen, Brendon Y. Chua, Łukasz Kedzierski, Chhay Lim, Masa Lasica, Gayani S Tennakoon, Natalie R Saunders, Megan Crane, Lynette Chee, John F. Seymour, Mary Ann Anderson, Ashley Whitechurch, E. Bridie Clemens, Wuji Zhang, So Young Chang, Jennifer R. Habel, Xiaoxiao Jia, Hayley A. McQuilten, Anastasia A. Minervina, Mikhail V. Pogorelyy, Priyanka Chaurasia, Jan Petersen, Tejas Menon, Luca Hensen, Jessica A. Neil, Francesca L. Mordant, Hyon‐Xhi Tan, Aira F. Cabug, Adam K. Wheatley, Stephen J. Kent, Kanta Subbarao, Theo Karapanagiotidis, Han Huang, Lynn K. Vo, Natalie Cain, Suellen Nicholson, Florian Krammer, Grace Gibney, Fiona James, Janine M. Trevillyan, Jason A. Trubiano, Jeni Mitchell, Britt Christensen, Katherine Bond, Deborah A. Williamson, Jamie Rossjohn, Jeremy Chase Crawford, Paul G. Thomas, Monica A. Slavin, Constantine S. Tam, Benjamin W. Teh, Katherine Kedzierska

Notice bibliographique

RevueCell Reports Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthModernaAmerican Lebanese Syrian Associated CharitiesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Health and Medical Research CouncilState Government of VictoriaBeiGeneCLL Global Research Foundation
Mots-clésHematologyMedicineImmunologyImmune systemVaccinationAntibodyCD8Internal medicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)T cellInfectious disease (medical specialty)Disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

T cells, together with their T cell receptor (TCR) repertoires, were robust in hematology patients, irrespective of B cell numbers, and comparable to healthy participants. Vaccinated patients with breakthrough infections developed higher antibody responses, while T cell responses were comparable to healthy groups. COVID-19 vaccination induces robust T cell immunity in hematology patients of varying diseases and treatments irrespective of B cell numbers and antibody response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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