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Enregistrement W4361018439 · doi:10.1136/ard-2022-222852

EULAR study group on ‘MHC-I-opathy': identifying disease-overarching mechanisms across disciplines and borders

2023· review· en· W4361018439 sur OpenAlexaff
Jonas J. W. Kuiper, Jörg C. Prinz, Efstratios Stratikos, Piotr Kuśnierczyk, Akiko Arakawa, Sebastian Springer, Dillon Mintoff, Ivan Padjen, Russka Shumnalieva, Seçil Vural, Ina Kötter, Marleen G. van de Sande, Ayşe Boyvat, Joke H. de Boer, George Βertsias, Niek de Vries, C. Krieckaert, Inês Leal, Nataša Vidović Valentinčič, İlknur Tuğal-Tutkun, Hanane el Khaldi Ahanach, Félicie Costantino, Simon Glatigny, Danijela Mrazovac Zimak, Fabian Lötscher, F. Kerstens, Marija Bakula, Elsa Viera Sousa, Peter Böhm, Kees Bosman, Tony Kenna, Simon J. Powis, Maxime Bréban, Ahmet Gül, John Bowes, Rik Lories, Johannes Nowatzky, Gertjan Wolbink, Dennis McGonagle, Franktien Turkstra

Notice bibliographique

RevueAnnals of the Rheumatic Diseases · 2023
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSpondyloarthritis Studies and Treatments
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesCilagNational Eye InstituteMedical Research CouncilNational Institutes of HealthJacobs UniversitySwedish Orphan BiovitrumAgence Nationale de la RechercheHarvard UniversityPfizerNorthwestern UniversityMassachusetts General HospitalSanofiAmgenDeutsche ForschungsgemeinschaftEli Lilly and Company
Mots-clésMajor histocompatibility complexMedicineDiseaseMHC class IImmunologyImmune systemPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 'MHC-I (major histocompatibility complex class I)-opathy' concept describes a family of inflammatory conditions with overlapping clinical manifestations and a strong genetic link to the MHC-I antigen presentation pathway. Classical MHC-I-opathies such as spondyloarthritis, Behçet's disease, psoriasis and birdshot uveitis are widely recognised for their strong association with certain MHC-I alleles and gene variants of the antigen processing aminopeptidases ERAP1 and ERAP2 that implicates altered MHC-I peptide presentation to CD8+T cells in the pathogenesis. Progress in understanding the cause and treatment of these disorders is hampered by patient phenotypic heterogeneity and lack of systematic investigation of the MHC-I pathway.Here, we discuss new insights into the biology of MHC-I-opathies that strongly advocate for disease-overarching and integrated molecular and clinical investigation to decipher underlying disease mechanisms. Because this requires transformative multidisciplinary collaboration, we introduce the EULAR study group on MHC-I-opathies to unite clinical expertise in rheumatology, dermatology and ophthalmology, with fundamental and translational researchers from multiple disciplines such as immunology, genomics and proteomics, alongside patient partners. We prioritise standardisation of disease phenotypes and scientific nomenclature and propose interdisciplinary genetic and translational studies to exploit emerging therapeutic strategies to understand MHC-I-mediated disease mechanisms. These collaborative efforts are required to address outstanding questions in the etiopathogenesis of MHC-I-opathies towards improving patient treatment and prognostication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,025
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,135

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0250,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,166
Tête enseignante GPT0,458
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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