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Enregistrement W4361190449 · doi:10.1111/mec.16915

Intestinal microbiota of <scp>Nearctic‐Neotropical</scp> migratory birds vary more over seasons and years than between host species

2023· article· en· W4361190449 sur OpenAlexfundno aff
Heather R. Skeen, David E. Willard, Andrew W. Jones, Benjamin M. Winger, Ethan F. Gyllenhaal, Brian R. Tsuru, Shannon J. Hackett, John Novembre

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Forest ServiceAchievement Rewards for College Scientists FoundationU.S. Fish and Wildlife ServiceEnvironment and Climate Change CanadaMichigan Department of Natural ResourcesMinnesota Department of Natural Resources
Mots-clésBiologyPasserineAbundance (ecology)EcologyAnnual cycleHost (biology)ZoologyNearctic ecozone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Seasonal migration of Nearctic-Neotropical passerine birds may have profound effects on the diversity and abundance of their host-associated microbiota. Migratory birds experience seasonal change in environments and diets throughout the course of the annual cycle that, along with recurrent biological events such as reproduction, may significantly impact their microbiota. In this study, we characterize the intestinal microbiota of four closely related species of migratory Catharus thrushes at three time points of their migratory cycle: during spring migration, on the summer breeding territories and during fall migration. Using observations replicated over 3 years, we determined that microbial community diversity of Catharus thrushes was significantly different across distinct time periods of the annual cycle, whereas community composition was more similar within than across years. Elevated alpha diversity in the summer birds compared to either migratory period indicated that birds may harbour a reduced microbiota during active migration. We also found that community composition of the microbiota did not substantially differ between host species. Finally, we recovered two phyla, Cyanobacteria and Planctomycetota, which are not commonly described from birds, that were in relatively high abundance in specific years. This study contributes to our growing understanding of how microbiota in wild birds vary throughout disparate ecological conditions and reveals potential axes across which an animal's microbial flexibility adapts to variable environments and recurrent biological conditions throughout the annual cycle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,035

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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