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Enregistrement W4361228079 · doi:10.1101/2023.03.28.534592

A Retina-Inspired Computational Model for Stimulation Efficacy Characterization and Implementation Optimization of Implantable Optogenetic Epi-Retinal Neuro-Stimulators

2023· preprint· en· W4361228079 sur OpenAlexafffund
Tayebeh Yousefi, Hossein Kassiri

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neural Engineering
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCMC Microsystems
Mots-clésOptogeneticsStimulationVisual prosthesisStimulus (psychology)RetinalRetinal implantVisual perceptionComputer scienceRetinaPerceptionNeuroscienceBiomedical engineeringEngineeringPsychologyMedicineOphthalmology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In this paper, a biologically-informed computational framework is developed to model the efficacy and to optimize the implementation of an implantable epi-retinal prosthesis that performs optogenetic stimulation through a μ LED array. The developed model is capable of translating visual stimulus inputs into corresponding signals evoked in the transfected retinal cells through optogenetic stimulation, calculating the subsequent neuronal activities of the following retinal layers, and estimating the resulted brain’s visual perception. As such, it can model and quantitatively analyze the impact of optical stimulation parameters (intensity, frequency, directivity, wavelength, etc.) and the μ LED array’s physical specifications (array size, density, pitch, implantation location, etc.) on the efficacy of the stimulation. Using this model, we compared optical and electrical stimulations in terms of the structural similarity between their induced visual perception in the brain and the visual stimulus input. We showed that thanks to the cell-type specificity of optogenetic stimulation, it can induce more relevant visual perception qualities than electrical stimulation. We also showed that its resulted visual perception substantially improves with scaling the stimulator’s array size. The model was also used to qualitatively and quantitatively analyze the impact of parameters such as implantation location, light intensity, single- and dual-wavelength stimulation, and illumination divergence angle on the quality of the optical-stimulation-induced visual perception. In each case, the simulation results were followed by our interpretation from a biological point of view. More importantly, in each case, we discussed how the results could be used for optimizing different parameters of an implantable optogenetic stimulator to achieve maximum efficacy and energy efficiency. Keywords: Retinal prosthesis, optogenetics, visual perception, optical stimulation, μ LED array, computational model, spatial resolution, pathway-specific stimulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,303
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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