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Enregistrement W4361253813 · doi:10.1158/0008-5472.c.6494432.v1

Data from A Novel Somatic Mouse Model to Survey Tumorigenic Potential Applied to the Hedgehog Pathway

2023· preprint· en· W4361253813 sur OpenAlexaff
Junhao Mao, Keith L. Ligon, Elena Y. Rakhlin, Sarah P. Thayer, Roderick T. Bronson, David H. Rowitch, Andrew P. McMahon

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensPediatric Oncology Group
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchBiologyHedgehogCarcinogenesisHedgehog signaling pathwayCre recombinasePatchedSmoothenedGenetically modified mouseTransgeneCancerSignal transductionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<div>Abstract<p>We report a novel mouse model for the generation of sporadic tumors and show the efficiency of this approach by surveying Hedgehog (Hh)–related tumors. Up-regulation of the Hh pathway is achieved by conditionally regulated expression of an activated allele of Smoothened (<i>R26-SmoM2</i>) using either sporadic leakage or global postnatal induction of a ubiquitously expressed inducible Cre transgene (<i>CAGGS-CreER</i>). Following postnatal tamoxifen induction, <i>CAGGS-CreER; R26-SmoM2</i> mice developed tumors with short latency and high penetrance. All mice exhibited rhabdomyosarcoma and basal cell carcinoma; 40% also developed medulloblastoma. In addition, mice showed a novel pancreatic lesion resembling low-grade mucinous cystic neoplasms in humans. In contrast, widespread activation of SmoM2 in the postnatal prostate epithelium results in no detectable morphologic outcome in 12-month-old mice. Comparison of gene expression profiles among diverse tumors identified several signature genes, including components of platelet-derived growth factor and insulin-like growth factor pathways, which may provide a common mechanistic link to the Hh-related malignancies. This experimental model provides a robust tool for exploring the process of Hh-dependent tumorigenesis and the treatment of such tumors. More generally, this approach provides a genetic platform for identifying tumorigenic potential in putative oncogenes and tumor suppressors and for more effective modeling of sporadic cancers in mice. (Cancer Res 2006; 66(20): 10171-7)</p></div>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,390
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,014
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,156
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,161 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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