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Enregistrement W4361266110 · doi:10.1158/0008-5472.c.6494585

Data from The c-Myc Oncogene Directly Induces the H19 Noncoding RNA by Allele-Specific Binding to Potentiate Tumorigenesis

2023· preprint· en· W4361266110 sur OpenAlexafffund
Dalia Barsyte-Lovejoy, Suzanne K. Lau, Paul C. Boutros, Fereshteh Khosravi, Igor Jurišica, Irene L. Andrulis, Ming‐Sound Tsao, Linda Z. Penn

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Syndromes and Imprinting
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of PennsylvaniaU.S. Department of Defense
Mots-clésGene knockdownBiologyChromatin immunoprecipitationGenomic imprintingCancer researchCarcinogenesisTranscription factorOncogeneLong non-coding RNAGeneMolecular biologyN-MycGene expressionPromoterDNA methylationGeneticsRNACell cycleCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<div>Abstract<p>The product of the <i>MYC</i> oncogene is widely deregulated in cancer and functions as a regulator of gene transcription. Despite an extensive profile of regulated genes, the transcriptional targets of c-Myc essential for transformation remain unclear. In this study, we show that c-Myc significantly induces the expression of the <i>H19</i> noncoding RNA in diverse cell types, including breast epithelial, glioblastoma, and fibroblast cells. c-Myc binds to evolutionarily conserved E-boxes near the imprinting control region to facilitate histone acetylation and transcriptional initiation of the <i>H19</i> promoter. In addition, c-Myc down-regulates the expression of insulin-like growth factor 2 (<i>IGF2</i>), the reciprocally imprinted gene at the <i>H19/IGF2</i> locus. We show that c-Myc regulates these two genes independently and does not affect <i>H19</i> imprinting. Indeed, allele-specific chromatin immunoprecipitation and expression analyses indicate that c-Myc binds and drives the expression of only the maternal <i>H19</i> allele. The role of H19 in transformation is addressed using a knockdown approach and shows that down-regulation of H19 significantly decreases breast and lung cancer cell clonogenicity and anchorage-independent growth. In addition, c-Myc and H19 expression shows strong association in primary breast and lung carcinomas. This work indicates that c-Myc induction of the <i>H19</i> gene product holds an important role in transformation. (Cancer Res 2006; 66(10): 5330-7)</p></div>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,363
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0040,009
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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