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Enregistrement W4361270738 · doi:10.1186/s44280-023-00010-2

Re-emergence of canine Leishmania infantum infection in mountain areas of Beijing

2023· article· en· W4361270738 sur OpenAlexaff
Gang Liu, Yuanheng Wu, Lei Wang, Yang Liu, Wei Huang, Yifan Li, Mengbo Gao, John P. Kastelic, Herman W. Barkema, Zhaofei Xia, Yipeng Jin

Notice bibliographique

RevueOne Health Advances · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesChina Agricultural University
Mots-clésLeishmania infantumBeijingMultilocus sequence typingLeishmaniasisCladeVeterinary medicineBiologyCanine leishmaniasisPhylogenetic treeChinaVirologyVisceral leishmaniasisGeographyGenotypeMedicineGeneImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Canine Leishmaniasis (CanL) is an endemic infectious disease in China, causing visceral Leishmaniasis (VL) and resulting in important public health problem. However, in the last 3 y, endemic trends have changed considerably and spatial–temporal aggregation areas have shifted from northwestern to central China. Although Beijing was an endemic area for CanL in the last century, this disease has not been reported in Beijing since control programs were implemented in the 1950s. In the present study, PCR and immunochromatographic (ICT) were used to estimate prevalence of Leishmania infection in domestic dogs living in Beijing, a VL re -emergencearea. In total, 4420 canine blood samples were collected at vet clinics in 14 districts of Beijing. Overall prevalence (percentage of dogs seropositive and/or PCR positive) of CanL infection in Beijing was 1.22% (54/4420). However, prevalence of CanL in the western mountain areas was 4.68% (45/961), significantly higher than that (0.26%, 9/3459) of the plains. In addition, multilocus sequence typing (MLST) of seven enzyme-coding genes was used to examine phylogenetic relationships of CanL strains. Forty-one Leishmania infantum isolates were well separated from the other strains and divided into five major clades (A to E) by MLST analysis. All clades were closely related to strains from Sichuan Province and Gansu Province. A phylogenetic tree, based on the MLST, revealed that L. infantum in Beijing was genetically related to strains from western endemic of Mountain type VL in China. In conclusion, CanL has re-emerged in Beijing, and almost 5% of dogs living in Beijing’s mountain areas were infected with L. infantum. The phylogenetic tree based on MLST effectively distinguished species of Leishmania and reflected geographical origins. Because dogs are considered a natural reservoir, comprehensive control measures including surveillance, phylogenetic analyses and management should be implemented to mitigate or eliminate Leishmaniasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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