Re-emergence of canine Leishmania infantum infection in mountain areas of Beijing
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Canine Leishmaniasis (CanL) is an endemic infectious disease in China, causing visceral Leishmaniasis (VL) and resulting in important public health problem. However, in the last 3 y, endemic trends have changed considerably and spatial–temporal aggregation areas have shifted from northwestern to central China. Although Beijing was an endemic area for CanL in the last century, this disease has not been reported in Beijing since control programs were implemented in the 1950s. In the present study, PCR and immunochromatographic (ICT) were used to estimate prevalence of Leishmania infection in domestic dogs living in Beijing, a VL re -emergencearea. In total, 4420 canine blood samples were collected at vet clinics in 14 districts of Beijing. Overall prevalence (percentage of dogs seropositive and/or PCR positive) of CanL infection in Beijing was 1.22% (54/4420). However, prevalence of CanL in the western mountain areas was 4.68% (45/961), significantly higher than that (0.26%, 9/3459) of the plains. In addition, multilocus sequence typing (MLST) of seven enzyme-coding genes was used to examine phylogenetic relationships of CanL strains. Forty-one Leishmania infantum isolates were well separated from the other strains and divided into five major clades (A to E) by MLST analysis. All clades were closely related to strains from Sichuan Province and Gansu Province. A phylogenetic tree, based on the MLST, revealed that L. infantum in Beijing was genetically related to strains from western endemic of Mountain type VL in China. In conclusion, CanL has re-emerged in Beijing, and almost 5% of dogs living in Beijing’s mountain areas were infected with L. infantum. The phylogenetic tree based on MLST effectively distinguished species of Leishmania and reflected geographical origins. Because dogs are considered a natural reservoir, comprehensive control measures including surveillance, phylogenetic analyses and management should be implemented to mitigate or eliminate Leishmaniasis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».