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Enregistrement W4361283412 · doi:10.1111/1462-2920.16376

Eelgrass ( <scp> <i>Zostera</i> </scp> spp.) associated phytomyxids are host‐specific congeneric parasites and predominant eukaryotes in the eelgrass rhizosphere on a global scale

2023· article· en· W4361283412 sur OpenAlexafffund
Viktorie Kolátková, Megan Mooney, Kate Kelly, Elitsa Hineva, Ryan M.R. Gawryluk, Joel K. Elliott

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésZostera marinaBiologySeagrassEcologyHost (biology)ZosteraAbundance (ecology)EcosystemEcosystem engineer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Together with increasing environmental and anthropogenic pressures, pathogenic diseases are one of the important factors contributing to the ongoing decline of seagrass meadows worldwide; yet the diversity and ecology of the microorganisms acknowledged as seagrass parasites remain critically understudied. Here, we investigate phytomyxid parasites (Rhizaria: Endomyxa: Phytomyxea) of three different eelgrass (Zostera spp.) species found in the Northern hemisphere. We present molecular evidence that Plasmodiophora bicaudata, a long-recognized parasite of dwarf eelgrass taxa, is closely related to the novel phytomyxid recently discovered in root hairs of Zostera marina, and together they form a distinct clade within the order Phagomyxida, proposed here as Feldmanniella gen. nov. A full life cycle is systematically described in a phagomyxid representative for the first time, proving its conformity with the generalized phytomyxid life history, despite previous uncertainties. The presence of primary infection stages in nearly all collected eelgrass specimens, and subsequent analysis of amplicon sequences from a global Z. marina dataset, reveal phytomyxids to be ubiquitous and one of the predominant microeukaryotes associated with eelgrass roots on a global scale. Our discoveries challenge the current view of Phytomyxea as rare entities in seagrass meadows and suggest their generally low pathogenicity in natural ecosystems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,183
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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