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Enregistrement W4361287559 · doi:10.1038/s41586-023-05754-w

Entwined African and Asian genetic roots of medieval peoples of the Swahili coast

2023· article· en· W4361287559 sur OpenAlexaff
Esther S. Brielle, Jeffrey Fleisher, Stephanie Wynne‐Jones, Kendra Sirak, Nasreen Broomandkhoshbacht, Kimberly Callan, Elizabeth Curtis, Lora Iliev, Ann Marie Lawson, Jonas Oppenheimer, Lijun Qiu, Kristin Stewardson, J. Noah Workman, Fatma Zalzala, George Ayodo, Agness Gidna, Angela Kabiru, Amandus Kwekason, Audax Mabulla, Fredrick K. Manthi, Emmanuel Ndiema, Christine Ogola, Elizabeth Sawchuk, Lihadh Al‐Gazali, Bassam R. Ali, Salma Ben‐Salem, Thierry Letellier, Denis Pierron, Chantal Radimilahy, Jean-Aimé Rakotoarisoa, Ryan L. Raaum, Brendan J. Culleton, Swapan Mallick, Nadin Rohland, Nick Patterson, Mohammed Ali Mwenje, Khalfan Bini Ahmed, Mohamed Mchulla Mohamed, Sloan R. Williams, Janet Monge, Sibel Kusimba, Mary E. Prendergast, David Reich, Chapurukha M. Kusimba

Notice bibliographique

RevueNature · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueGlobal Maritime and Colonial Histories
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesUK Research and InnovationNational Human Genome Research InstitutePaul G. Allen Family FoundationJohn Templeton FoundationArts and Humanities Research CouncilMinistry of Natural Resources and TourismHoward Hughes Medical InstituteNational Geographic SocietyNational Endowment for the HumanitiesNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésSwahiliIslamGeographyPersianAncient historyHistoryEthnologyArchaeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The urban peoples of the Swahili coast traded across eastern Africa and the Indian Ocean and were among the first practitioners of Islam among sub-Saharan people1,2. The extent to which these early interactions between Africans and non-Africans were accompanied by genetic exchange remains unknown. Here we report ancient DNA data for 80 individuals from 6 medieval and early modern (ad 1250–1800) coastal towns and an inland town afterad 1650. More than half of the DNA of many of the individuals from coastal towns originates from primarily female ancestors from Africa, with a large proportion—and occasionally more than half—of the DNA coming from Asian ancestors. The Asian ancestry includes components associated with Persia and India, with 80–90% of the Asian DNA originating from Persian men. Peoples of African and Asian origins began to mix by aboutad 1000, coinciding with the large-scale adoption of Islam. Before aboutad 1500, the Southwest Asian ancestry was mainly Persian-related, consistent with the narrative of the Kilwa Chronicle, the oldest history told by people of the Swahili coast3. After this time, the sources of DNA became increasingly Arabian, consistent with evidence of growing interactions with southern Arabia4. Subsequent interactions with Asian and African people further changed the ancestry of present-day people of the Swahili coast in relation to the medieval individuals whose DNA we sequenced.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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