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Enregistrement W4361295501 · doi:10.12688/f1000research.132249.1

The identification of high-performing antibodies for Profilin-1 for use in Western blot, immunoprecipitation and immunofluorescence

2023· preprint· en· W4361295501 sur OpenAlexafffund
Riham Ayoubi, Ian McDowell, Maryam Fotouhi, Kathleen Southern, Peter S. McPherson, Carl Laflamme

Notice bibliographique

RevueF1000Research · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensMcGill UniversityStructural Genomics ConsortiumMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGenentechMitacsMotor Neurone Disease AssociationGovernment of CanadaOntario Genomics InstituteEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaABayerALS Society of CanadaOntario GenomicsGenome CanadaBristol-Myers SquibbPfizerALS Association
Mots-clésWestern blotImmunofluorescenceOpen peer reviewImmunoprecipitationPlant biologyIdentification (biology)AntibodyBiologyMedicineComputational biologyImmunologyGeneBotanyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Profilin-1, a member of the Profilin family, is a ubiquitously expressed protein that controls actin polymerization in a concentration-dependent manner. As mutations in the Profilin-1 gene have potential implications in neurodegenerative disease progression, well-characterized anti-Profilin-1 antibodies would be beneficial to the scientific community. In this study, we characterized sixteen Profilin-1 commercial antibodies for Western blot, immunoprecipitation, and immunofluorescence applications, using a standardized experimental protocol based on comparing read-outs in knockout cell lines and isogenic parental controls. We identified many high-performing antibodies and encourage readers to use this report as a guide to select the most appropriate antibody for their specific needs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,510
Score d'incertitude au seuil0,691

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,403
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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