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Enregistrement W4361822151 · doi:10.1158/0008-5472.c.6500325

Data from Role of Peroxisome Proliferator-Activated Receptor-γ and Its Coactivator DRIP205 in Cellular Responses to CDDO (RTA-401) in Acute Myelogenous Leukemia

2023· preprint· en· W4361822151 sur OpenAlexaff
Twee Tsao, Steven M. Kornblau, Stephen Safe, Julie C. Watt, Vivian Ruvolo, Wenjing Chen, Yihua Qiu, Kevin R. Coombes, Zhenlin Ju, Maen Abdelrahim, Wendy Schober, Xiaoyang Ling, Dimitris Kardassis, Colin Meyer, Aaron D. Schimmer, Hagop M. Kantarjian, Michael Andreeff, Marina Konopleva

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCoactivatorPeroxisome proliferator-activated receptorNuclear receptorApoptosisTransfectionCancer researchMyeloid leukemiaReceptorCell biologyChemistryBiologyEndocrinologyInternal medicineTranscription factorCell cultureMedicineBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Peroxisome proliferator-activated receptor-γ (PPARγ) is a member of the nuclear receptor (NR) family of transcription factors with important regulatory roles in cellular growth, differentiation, and apoptosis. Using proteomic analysis, we showed expression of PPARγ protein in a series of 260 newly diagnosed primary acute myelogenous leukemia (AML) samples. Forced expression of PPARγ enhanced the sensitivity of myeloid leukemic cells to apoptosis induced by PPARγ agonists 2-cyano-3,12-dioxooleana-1,9-dien-28-oic acid (CDDO) and 15-deoxy-12,14-15DPGJ2, through preferential cleavage of caspase-8. No effects on cell cycle distribution or differentiation were noted, despite prominent induction of p21 in PPARγ-transfected cells. In turn, antagonizing PPARγ function by small interfering RNA or pharmacologic PPARγ inhibitor significantly diminished apoptosis induction by CDDO. Overexpression of coactivator protein DRIP205 resulted in enhanced differentiation induction by CDDO in AML cells through PPARγ activation. Studies with DRIP205 deletion constructs showed that the NR boxes of DRIP205 are not required for this coactivation. In a phase I clinical trial of CDDO (RTA-401) in leukemia, CDDO induced an increase in PPARγ mRNA expression in six of nine patient samples; of those, induction of differentiation was documented in four patients and that of p21 in three patients, all expressing DRIP205 protein. In summary, these findings suggest that cellular levels of PPARγ regulate induction of apoptosis via caspase-8 activation, whereas the coactivator DRIP205 is a determinant of induction of differentiation, in response to PPARγ agonists in leukemic cells. Cancer Res; 70(12); 4949–60. ©2010 AACR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
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