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Enregistrement W4361841397 · doi:10.1158/0008-5472.22425820.v1

Supplementary Materials from Epigenetic Control of <i>Cdkn2a.Arf</i> Protects Tumor-Infiltrating Lymphocytes from Metabolic Exhaustion

2023· preprint· en· W4361841397 sur OpenAlexfundno aff
Brian Koss, Bradley D. Shields, Erin M. Taylor, Aaron J. Storey, Stephanie D. Byrum, Allen Gies, Charity L. Washam, Samrat Roy Choudhury, Jeong Hyun Ahn, Hidetaka Uryu, Jason B. Williams, Kimberly J. Krager, Tung-Chin Chiang, Samuel G. Mackintosh, Rick D. Edmondson, Nükhet Aykin‐Burns, Thomas F. Gajewski, Gang Greg Wang, Alan J. Tackett

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBC Cancer AgencyGraduate School, University of MarylandBroad Institute
Mots-clésEZH2EpigeneticsReprogrammingHistoneCancer researchCDKN2AHistone methyltransferaseBiologyChemistryCellGeneticsCancerGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Figure S1-7. Figure S1: Assessing the effect of EZH2i on in vitro T cell cytotoxic function. Figure S2: Systems approach uncovers drivers of T cell exhaustion resulting from EZH2-inhibtion. Figure S3: Loss of EZH2 function leads to metabolic exhaustion of T cells. Figure S4: Histone epigenetic landscape post EZH2 inhibition. Figure S5: EZH2 inhibition leads to histone epigenetic reprogramming. Figure S6: Arf contributes metabolic exhaustion independent of p53. Figure S7: Exogenous expression of EZH2Y641F in lymphocytes. Extended methods, table of key reagents and resources

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,725
Score d'incertitude au seuil0,393

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,7250,333

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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