Data from Histone Deacetylase 8 in Neuroblastoma Tumorigenesis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Purpose: The effects of pan–histone deacetylase (HDAC) inhibitors on cancer cells have shown that HDACs are involved in fundamental tumor biological processes such as cell cycle control, differentiation, and apoptosis. However, because of the unselective nature of these compounds, little is known about the contribution of individual HDAC family members to tumorigenesis and progression. The purpose of this study was to evaluate the role of individual HDACs in neuroblastoma tumorigenesis. Experimental Design: We have investigated the mRNA expression of all HDAC1-11 family members in a large cohort of primary neuroblastoma samples covering the full spectrum of the disease. HDACs associated with disease stage and survival were subsequently functionally evaluated in cell culture models. Results: Only HDAC8 expression was significantly correlated with advanced disease and metastasis and down-regulated in stage 4S neuroblastoma associated with spontaneous regression. High HDAC8 expression was associated with poor prognostic markers and poor overall and event-free survival. The knockdown of HDAC8 resulted in the inhibition of proliferation, reduced clonogenic growth, cell cycle arrest, and differentiation in cultured neuroblastoma cells. The treatment of neuroblastoma cell lines as well as short-term-culture neuroblastoma cells with an HDAC8-selective small-molecule inhibitor inhibited cell proliferation and clone formation, induced differentiation, and thus reproduced the HDAC8 knockdown phenotype. Global histone 4 acetylation was not affected by HDAC8 knockdown or by selective inhibitor treatment. Conclusions: Our data point toward an important role of HDAC8 in neuroblastoma pathogenesis and identify this HDAC family member as a specific drug target for the differentiation therapy of neuroblastoma.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».