Data from MicroRNA Expression in Squamous Cell Carcinoma and Adenocarcinoma of the Esophagus: Associations with Survival
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Purpose: The dismal outcome of esophageal cancer patients highlights the need for novel prognostic biomarkers, such as microRNAs (miRNA). Although recent studies have established the role of miRNAs in esophageal carcinoma, a comprehensive multicenter study investigating different histologic types, including squamous cell carcinoma (SCC) and adenocarcinoma with or without Barrett's, is still lacking. Experimental Design: miRNA expression was measured in cancerous and adjacent noncancerous tissue pairs collected from 100 adenocarcinoma and 70 SCC patients enrolled at four clinical centers from the United States, Canada, and Japan. Microarray-based expression was measured in a subset of samples in two cohorts and was validated in all available samples. Results: In adenocarcinoma patients, miR-21, miR-223, miR-192, and miR-194 expression was elevated, whereas miR-203 expression was reduced in cancerous compared with noncancerous tissue. In SCC patients, we found elevated miR-21 and reduced miR-375 expression levels in cancerous compared with noncancerous tissue. When comparing cancerous tissue expression between adenocarcinoma and SCC patients, miR-194 and miR-375 were elevated in adenocarcinoma patients. Significantly, elevated miR-21 expression in noncancerous tissue of SCC patients and reduced levels of miR-375 in cancerous tissue of adenocarcinoma patients with Barrett's were strongly associated with worse prognosis. Associations with prognosis were independent of tumor stage or nodal status, cohort type, and chemoradiation therapy. Conclusions: Our multicenter-based results highlight miRNAs involved in major histologic types of esophageal carcinoma and uncover significant associations with prognosis. Elucidating miRNAs relevant to esophageal carcinogenesis is potentially clinically useful for developing prognostic biomarkers and identifying novel drug targets and therapies. (Clin Cancer Res 2009;15(19):6192–200)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».