MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4361943975 · doi:10.1158/1078-0432.c.6517933

Data from A Cohort Study of Cyclin D1 Expression and Prognosis in 602 Colon Cancer Cases

2023· preprint· en· W4361943975 sur OpenAlexfundno aff
Shuji Ogino, Katsuhiko Nosho, Natsumi Irahara, Shoko Kure, Kaori Shima, Yoshifumi Baba, Saori Toyoda, Li Chen, Edward L. Giovannucci, Jeffrey A. Meyerhardt, Charles S. Fuchs

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Lipids, and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthGary Bennett Family Fund
Mots-clésCyclin D1KRASColorectal cancerHazard ratioInternal medicineCancer researchCancerMicrosatellite instabilityBiologyMedicineOncologyCell cycleConfidence intervalGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose: Cyclin D1 and cyclin-dependent kinases (CDK) are commonly activated in colorectal cancer. The activity of cyclin D1 can be blocked by CDK inhibitors, including p27 (CDKN1B) and p21 (CDKN1A, which is induced by p53). However, prognostic significance of tumoral cyclin D1 remains uncertain, and no previous study has considered potential confounding effect of p53, p21, p27, and related molecular events [microsatellite instability (MSI), CpG island methylator phenotype, and LINE-1 hypomethylation]. Experimental Design: Among 602 colon cancer patients (stage I-IV) in two prospective cohort studies, cyclin D1 overexpression was detected in 330 (55%) tumors by immunohistochemistry. Cox proportional hazard models computed hazard ratios (HR) of colon cancer–specific and overall mortalities, adjusted for patient characteristics and tumoral molecular features, including p53, p21, p27, cyclooxygenase-2, fatty acid synthase, LINE-1 methylation, CpG island methylator phenotype, MSI, BMI, KRAS, and BRAF. Results: Cyclin D1 overexpression was associated with a low cancer-specific mortality in Kaplan-Meier analysis (P = 0.006), and in both univariate Cox regression [unadjusted HR, 0.64; 95% confidence interval (CI), 0.47-0.88; P = 0.0063] and multivariate analyses (adjusted HR, 0.57; 95% CI, 0.39-0.84; P = 0.0048). Similar findings were observed for an overall mortality (adjusted HR, 0.74; 95% CI, 0.57-0.98; P = 0.036). Notably, the effect of cyclin D1 on survival might differ by MSI status (Pinteraction = 0.008). Compared with tumors that were both cyclin D1–negative and MSI-low/microsatellite stable, the presence of either cyclin D1 or MSI-high or both seemed to confer better clinical outcome (adjusted HR point estimates, 0.10-0.65). Conclusions: Cyclin D1 overexpression is associated with longer survival in colon cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,030

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetCancer, Lipids, and MetabolismTravaux en français237 207