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Enregistrement W4361946783 · doi:10.1158/1078-0432.c.6529806

Data from FGFR2c Mesenchymal Isoform Expression Is Associated with Poor Prognosis and Further Refines Risk Stratification within Endometrial Cancer Molecular Subtypes

2023· preprint· en· W4361946783 sur OpenAlexaboutno aff
Asmerom T. Sengal, Ann‐Marie Patch, Cameron Snell, Deborah S. Smith, Samuel Leung, Aline Talhouk, Elizabeth D. Williams, Jessica N. McAlpine, Pamela M. Pollock

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFibroblast Growth Factor Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndometrial cancerInternal medicineMedicineOncologyCohortProportional hazards modelRisk stratificationCancerCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<div>AbstractPurpose:<p>The two most common molecular subtypes of endometrial cancers, mismatch repair deficient (MMRd) and p53 wild-type (p53wt) comprise the majority of endometrial cancers and have intermediate prognoses where additional risk stratification biomarkers are needed. Isoform switching of FGFR2 from FGFR2b to FGFR2c (normally expressed in mesenchymal cells), has been reported in other solid carcinomas. The objective of this study was to investigate the role of FGFR2c in risk stratification of endometrial cancer.</p>Experimental Design:<p>We have developed and optimized a BaseScope RNA ISH assay to detect FGFR2c. FGFR2c expression was determined in a preliminary screening cohort of 78 endometrial cancers and a clinically and molecularly annotated Vancouver cohort (<i>n</i> = 465). Cox regression model analyses were performed to assess the prognostic value of FGFR2c.</p>Results:<p>Univariate and multivariate analyses revealed FGFR2c expression was significantly associated with shorter disease-specific survival (DSS) and progression-free survival (PFS) in endometrioid endometrial cancer (EEC, <i>n</i> = 302). Notably, FGFR2c expression was significantly associated with shorter PFS and DSS in patients with grade 3 EECs (<i>P</i> < 0.003 and <i>P</i> < 0.002) and the European Society Medical Oncology (ESMO) high-risk group (<i>P</i> < 0.0001 and <i>P</i> < 0.002), respectively. Moreover, within the MMRd subtype, FGFR2c expression was significantly associated with shorter PFS (<i>P</i> < 0.048) and DSS (<i>P</i> < 0.001).</p>Conclusions:<p>FGFR2c expression appears an independent prognostic biomarker in patients with EEC and further discerns the outcomes within grade 3 tumors, ESMO high-risk groups, as well as within the MMRd and p53wt subtypes. FGFR2c inclusion into future molecular subtyping can further refine risk stratification of EEC.</p></div>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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