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Enregistrement W4361988864 · doi:10.1177/17588359231156382

A transcriptomics approach to expand therapeutic options and optimize clinical trials in oncology

2023· article· en· W4361988864 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueTherapeutic Advances in Medical Oncology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesFP7 HealthPharmacyclicsSanofi GenzymeGenentechDaiichi Sankyo EuropeNational Cancer InstituteServierAstraZenecaInstitut National Du CancerCanadian Cancer SocietyFoundation MedicineFondation ARC pour la Recherche sur le CancerSeagenPuma BiotechnologyActuate TherapeuticsSymphogenPfizerIncyteGrifolsEQRxBeiGeneEuropean CommissionSanofiHalozymeChugai PharmaceuticalIsrael Science FoundationIpsenArray BioPharmaBristol-Myers SquibbEli Lilly and CompanyAmerican Society of Clinical OncologyInstituto de Salud Carlos IIIAmgenNovartis Pharmaceuticals CorporationLes Laboratories Pierre Fabre
Mots-clésMedicineOncologyClinical trialInternal medicineImmunotherapyMetastasisCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The current model of clinical drug development in oncology displays major limitations due to a high attrition rate in patient enrollment in early phase trials and a high failure rate of drugs in phase III studies. Objective: Integrating transcriptomics for selection of patients has the potential to achieve enhanced speed and efficacy of precision oncology trials for any targeted therapies or immunotherapies. Methods: Relative gene expression level in the metastasis and normal organ-matched tissues from the WINTHER database was used to estimate in silico the potential clinical benefit of specific treatments in a variety of metastatic solid tumors. Results: As example, high mRNA expression in tumor tissue compared to analogous normal tissue of c-MET and its ligand HGF correlated in silico with shorter overall survival (OS; p < 0.0001) and may constitute an independent prognostic marker for outcome of patients with metastatic solid tumors, suggesting a strategy to identify patients most likely to benefit from MET-targeted treatments. The prognostic value of gene expression of several immune therapy targets (PD-L1, CTLA4, TIM3, TIGIT, LAG3, TLR4) was investigated in non-small-cell lung cancers and colorectal cancers (CRCs) and may be useful to optimize the development of their inhibitors, and opening new avenues such as use of anti-TLR4 in treatment of patients with metastatic CRC. Conclusion: This in silico approach is expected to dramatically decrease the attrition of patient enrollment and to simultaneously increase the speed and detection of early signs of efficacy. The model may significantly contribute to lower toxicities. Altogether, our model aims to overcome the limits of current approaches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,016
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,981
Score d'incertitude au seuil0,911

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0160,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,178
Tête enseignante GPT0,511
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle