Uip4 governs growth phase dependent organelle remodeling by modulating <i>Saccharomyces cerevisiae</i> lipidome
Notice bibliographique
Résumé
Abstract When yeast cells are exposed to nutrient-limiting conditions, they undergo transcriptional and translational reprogramming that results in the remodelling of metabolite utilization and organelle architecture. Organelle membranes and contacts also undergo structural and functional alterations. In the budding yeast Saccharomyces cerevisiae, regulated expression of Uip4 is shown to be a critical effector of nuclear shape and function, particularly during the stationary phase. In this work, we demonstrate that the absence of UIP4 affects the morphology of multiple other organelles including mitochondria, endoplasmic reticulum, vacuole and the distribution of lipid droplets. The results show that modulating carbon source, nitrogen availability and cellular energy state impact Uip4 expression. This expression of Uip4 is controlled by the transcription factor Msn2, downstream of Sch9 signaling pathway. Cells lacking Uip4 have poor survival in the stationary phase of the growth cycle. These cellular changes are concomitant with dysregulation of the global lipidome profile and aberrant organelle interaction. We propose that the dynamic and regulated expression of Uip4 is required to maintain lipid homeostasis and organelle architecture which is ultimately required to survive in nutrient limiting conditions such as stationary phase.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».