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Enregistrement W4362455586 · doi:10.1002/dvdy.587

Editorial Highlights

2023· editorial· en· W4362455586 sur OpenAlexaboutno aff
Paul A. Trainor

Notice bibliographique

RevueDevelopmental Dynamics · 2023
Typeeditorial
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueOcular Disorders and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyZebrafishSonic hedgehogModel organismGeneticsCell biologySignal transductionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Every organism is a model organism for understanding development, evolution, disease, and regeneration, and we have only begun to scratch the surface of the interdisciplinary genetic, molecular, cellular, and developmental mechanisms that regulate these biological processes. These “Highlights” denote exciting advances recently reported in Developmental Dynamics that illustrate the complex dynamics of developmental biology. Ocular Development and Disease. “Zebrafish model of RERE syndrome recapitulates key ophthalmic defects that are rescued by small molecule inhibitor of shh signaling” by Aman George, Jerry Lee, James Liu, Suzie Kim and Brian Brooks; DevDyn 252:4, pp. 495-509; https://doi.org/10.1002/dvdy.561. Mutations in the human RERE gene (ATROPHIN 2, OMIM *605226) are associated with a neuro-developmental disorder that includes ophthalmic, cardiac, genitourinary and hearing defects. This study demonstrates that rerea mutant (babyface) zebrafish recapitulate the optic fissure closure defects that result from loss of RERE function in humans. Interestingly, the RERE gene acts as a transcriptional corepressor in various nuclear receptor signaling pathways, and the optic fissure phenotype is associated with expansion of proximal retinal optic stalk in concert with deregulated shh signaling. Consistent with this model, inhibiting shh signaling can rescue the coloboma phenotype. Craniofacial Biology. “Frem1 activity is regulated by Sonic Hedgehog signaling in the cranial neural crest mesenchyme during midfacial morphogenesis” by Matthew McLaughlin, Miranda Sun, Tyler Beames, Austin Steward, Joshua Theisen, Hannah Chung, Joshua Everson, Ivan Moskowitz, Michael Sheets and Robert Lipinski; DevDyn 252:4, pp. 483-494; https://doi.org/10.1002/dvdy.555. The human face exhibits remarkable variation, and is also highly prone to developmental anomalies. The Frem/Fras family of extracellular matrix proteins has been implicated in regulating face shape variation as well as being mutated in the pathogenesis of disorders such as Manitoba-oculo-tricho-anal bifid nose with or without anorectal and renal anomalies, and Fraser syndromes. This study examined the activity of Frem1 during facial morphogenesis and identified Sonic Hedgehog (Shh) as an upstream regulator that promotes the proliferation of neural crest cells. Shh-Frem1 signaling is disrupted during the pathogenesis of midface hypoplasia, which provides deeper insights into the mechanisms underlying congenital craniofacial anomalies, and variation in midfacial morphogenesis. Organogenesis. “Foxd1 is required for 3D patterning of the kidney interstitial matrix by Sarah Lipp, Kathryn Jacobson, Andrew Schwaderer, David Hains and Sarah Calve; DevDyn 252:4, pp. 463-482; https://doi.org/10.1002/dvdy.545. The extracellular matrix (ECM) comprises a complex network of proteins and glycosaminoglycans that functions as a reservoir of growth factors, while also providing structural integrity and support during kidney development. This study combined 3D imaging and proteomics to investigate the role of Foxd1 in stromal cells, which are responsible for synthesizing the interstitial extracellular matrix, and document how the extracellular matrix dynamically changes during normal murine kidney development and in a model of kidney hypodysplasia. Changes in interstitial extracellular matrix corresponded to disruptions in stromal cell patterning, which helps to shed light on why human patients with connective tissue disorders have an increased incidence of kidney cysts and congenital anomalies of the kidney and urinary tract.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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