The frequency and differential pleiotropy of phenotypic nonspecificity in <i>Drosophila melanogaster</i>
Notice bibliographique
Résumé
The regulation of the initiation of transcription by transcription factors is often assumed to be dependent on specific recognition of DNA-binding sites and nonredundant. However, the redundant induction or rescue of a phenotype by transcription factors, phenotypic nonspecificity, challenges these assumptions. To assess the frequency of phenotypic nonspecificity in the rescue of transcription factor phenotypes, seven transcription factor phenotypes (labial, Deformed, Sex combs reduced, Ultrabithorax, fruitless, doublesex, and apterous) were screened for rescue by the expression of 12, or more, nonresident transcription factors. From 308 assessments of rescue by nonresident transcription factors, 18 rescues were identified across 6 of the 7 transcription factor phenotypes. Seventeen of the 18 rescues were with transcription factors that recognize distinct DNA-binding sites relative to the resident transcription factors. All rescues were nonuniform across pleiotropic transcription factor phenotypes suggesting extensive differential pleiotropy of the rescue. Primarily using RNAi to knockdown expression, and with the exceptions of the requirement of Bric a Brac 1 for female abdominal pigmentation and Myb oncogene-like for wing development, no evidence was found for a role of the other 16 nonresident transcription factor in the transcription factor phenotypes assessed. Therefore, these 16 rescues are likely due to functional complementation and not due to the expression of an epistatic function in the developmental/behavioral pathway. Phenotypic nonspecificity is both differentially pleiotropic and frequent, as on average 1 in 10-20 nonresident transcription factors rescue a phenotype. These observations will be important in future considerations of transcription factors function.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».