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Enregistrement W4362468416 · doi:10.1371/journal.pgph.0001754

Updating the WHO target product profile for next-generation Mycobacterium tuberculosis drug susceptibility testing at peripheral centres

2023· article· en· W4362468416 sur OpenAlexaff
Emily MacLean, Paolo Miotto, Licé González-Angulo, Matteo Chiacchiaretta, A Sarah Walker, Martina Casenghi, Camilla Rodrigues, Timothy C. Rodwell, Philip Supply, Emmanuel André, Mikashmi Kohli, Morten Rühwald, Daniela María Cirillo, Nazir Ismail, Matteo Zignol

Notice bibliographique

RevuePLOS Global Public Health · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesWellcome TrustWorld Health OrganizationUnited States Agency for International Development
Mots-clésTuberculosisGeneral partnershipMedicineMycobacterium tuberculosisProduct (mathematics)DrugDrug resistanceIntensive care medicinePharmacologyBusinessPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There were approximately 10 million tuberculosis (TB) cases in 2020, of which 500,000 were drug-resistant. Only one third of drug-resistant TB cases were diagnosed and enrolled on appropriate treatment, an issue partly driven by a lack of rapid, accurate drug-susceptibility testing (DST) tools deployable in peripheral settings. In 2014, World Health Organization (WHO) published target product profiles (TPPs) which detailed minimal and optimal criteria to address high-priority TB diagnostic needs, including DST. Since then, the TB community's needs have evolved; new treatment regimens, changes in TB definitions, further emergence of drug resistance, technological advances, and changing end-users requirements have necessitated an update. The DST TPP's revision was therefore undertaken by WHO with the Stop TB Partnership New Diagnostics Working Group. We describe the process of updating the TPP for next-generation TB DST for use at peripheral centres, highlight key updates, and discuss guidance regarding technical and operational specifications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,064
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,108
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil0,338

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0640,108
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0050,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0070,005
Science ouverte0,0030,004
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,011

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,137
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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