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Enregistrement W4362471092 · doi:10.3390/genes14040832

A Systematic Review of the Heterogenous Gene Expression Patterns Associated with Multidrug Chemoresistance in Conventional Osteosarcoma

2023· review· en· W4362471092 sur OpenAlexaboutno aff
Phakamani G. Mthethwa, Leonard Marais, Veron Ramsuran, Colleen Aldous

Notice bibliographique

RevueGenes · 2023
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOsteosarcomaMultiple drug resistanceBiologyGeneBioinformaticsDrug resistanceCancer researchComputational biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multidrug chemoresistance (MDR) remains the most significant obstacle to improving survival in osteosarcoma patients. Heterogeneous genetic alterations characterise the tumour microenvironment, and host molecular markers have been associated with MDR. This systematic review examines the genetic alterations of molecular biomarkers associated with multidrug chemotherapy resistance in genome-wide analysis of central high-grade conventional osteosarcoma (COS). We systematically searched MEDLINE, EMBASE, Web of Science, Wiley online library and Scopus. Only human studies involving genome-wide analysis were included, while candidate gene, in vitro and animal studies were excluded. The risk of bias of the studies was assessed using the Newcastle-Ottawa Quality Assessment Scale. The systematic search identified 1355 records. Following the screening, six studies were included in the qualitative analysis. There were 473 differentially expressed genes (DEGs) associated with chemotherapy response in COS. Fifty-seven of those were associated with MDR in osteosarcoma. The heterogeneous gene expressions were related to the mechanism of MDR in osteosarcoma. The mechanisms include drug-related sensitivity genes, bone remodelling and signal transduction. Complex, variable and heterogenous gene expression patterns underpin MDR in osteosarcoma. Further research is needed to identify the most relevant alterations for prognostication and to guide the development of possible therapeutic targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,003
Bibliométrie0,0110,015
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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