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Enregistrement W4362542732 · doi:10.1158/1538-7445.am2023-3934

Abstract 3934: PRMT5 is an actionable target in CDK4/6 inhibitor-resistant ER+/Rb-deficient breast cancer

2023· article· en· W4362542732 sur OpenAlexaff
Chang‐Ching Lin, Tsung-Cheng Chang, Yunguan Wang, Yanfeng Zhang, Andrew Lemoff, Yisheng Fang, He Zhang, Dan Ye, Isabel Soria‐Bretones, Alberto Servetto, Kyung‐min Lee, Xuemei Luo, Joseph J. Otto, Hiroaki Akamatsu, David W. Cescon, Lin Xu, Yang Xie, Joshua T. Mendell, Ariella B. Hanker, Carlos L. Arteaga

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtein arginine methyltransferase 5BiologyCancer researchCancerCell cycleCell growthProstate cancerMolecular biologyMethyltransferaseGeneticsGeneMethylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract RB1 loss-of-function genomic alterations confer resistance to CDK4/6 inhibitors (CDK4/6i) and are enriched post treatment of CDK4/6i in estrogen receptor-positive (ER+) metastatic breast cancer. ER+/Rb-deficient breast cancer is a rising patient population in need of novel therapeutic strategies. Herein, we used a genome-wide CRISPR screen and identified protein arginine methyltransferase 5 (PRMT5) as a molecular vulnerability in this refractory breast cancer subtype. sgRNA-induced depletion of PRMT5 arrested growth of MCF-7 and T47D RB1 knockout (RBKO) cells. PRMT5 catalyzes symmetric dimethylation of arginine (SDMA). In RBKO cells carrying doxycycline-inducible shRNA targeting the 3’UTR of PRMT5, rescue with wild-type but not an enzymatically dead mutant of PRMT5 restored cell growth, supporting that PRMT5 methyltrasferase activity is essential for growth of these cells. Gene set enrichment analysis (GSEA) of RNA-seq data revealed significant downregulation of cell cycle-related Hallmark gene signatures in RBKO cells treated with PRMT5 siRNA versus control siRNA. Both gene silencing and pharmacological blockade of PRMT5 with the small molecule inhibitor pemrametostat impeded G1-to-S cell cycle progression in MCF-7 and T47D RBKO cells and in lung, prostate, and triple-negative breast cancer cells with natural RB1 mutations or deletions, suggesting that PRMT5 inhibition can block the G1-to-S transition even in the absence of Rb. To identify the protein interactome of PRMT5 and the mechanism by which it promotes cell cycle progression in Rb-deficient cells, we performed proteomics analysis of Co-IP mass spectrometry and an SDMA post-translational modification scan and pinpointed FUS (fused in sarcoma) as a putative downstream effector of PRMT5. FUS is known to regulate RNA polymerase II (Pol II)-mediated transcription. Inhibition of PRMT5 with pemrametostat significantly reduced SDMA levels on FUS and dissociated FUS from Pol II as evidenced by FUS Co-IP and immunoblot analysis. ChIP-seq analysis revealed that treatment of RBKO cells with pemrametostat derepressed phosphorylation of Ser2 in the C-terminus of Pol II at transcription start sites (TSS) of genes involved in cell cycle progression. In accordance with the abnormal accumulation of pSer2 Pol II at TSS, pemrametostat treatment also resulted in an increased Pol II pausing index and an enrichment of intron retention splicing variants. Finally, therapeutic inhibition of PRMT5 with pemrametostat synergized with fulvestrant (a selective ER degrader) against growth of ER+/Rb-deficient breast cancer cell line- and patient-derived xenografts in mice, suggesting this combination as a novel therapeutic strategy for ER+/Rb-deficient metastatic breast cancers. Citation Format: Chang-Ching Lin, Tsung-Cheng Chang, Yunguan Wang, Yanfeng Zhang, Andrew Lemoff, Yisheng V. Fang, He Zhang, Dan Ye, Isabel Soria-Bretones, Alberto Servetto, Kyung-min Lee, Xuemei Luo, Joseph J. Otto, Hiroaki Akamatsu, David W. Cescon, Lin Xu, Yang Xie, Joshua T. Mendell, Ariella B. Hanker, Carlos L. Arteaga. PRMT5 is an actionable target in CDK4/6 inhibitor-resistant ER+/Rb-deficient breast cancer. [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2023; Part 1 (Regular and Invited Abstracts); 2023 Apr 14-19; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2023;83(7_Suppl):Abstract nr 3934.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,376
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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