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Enregistrement W4362546319 · doi:10.1158/1538-7445.am2023-3445

Abstract 3445: Immune cells infiltration and activation are higher in breast cancers resistant to antiestrogen therapy

2023· article· en· W4362546319 sur OpenAlexaff
Fabiana Napolitano, Dhivya R. Sudhan, Yunguan Wang, Paula I. González-Ericsson, Luigi Formisano, Kyungmin Lee, Chang‐Ching Lin, M Rosario Chica-Parrado, Hongli Ma, Nathaniel Evans, Alberto Servetto, Saurabh Mendiratta, Spencer Barnes, Yisheng Fang, Justin M. Balko, Gordon B. Mills, Marilyne Labrie, Ariella B. Hanker, Carlos L. Arteaga

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemokine receptors and signaling
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStromal cellTumor-infiltrating lymphocytesTumor microenvironmentImmune systemEstrogen receptorPathologyTissue microarrayBreast cancerMedicineCancer researchCancerBiologyImmunohistochemistryInternal medicineImmunologyImmunotherapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We investigated the tumor microenvironment (TME) in estrogen receptor positive (ER+) primary breast cancers from stage I-III patients treated with estrogen deprivation (ED, induced with letrozole) for 10-21 days. We used primary breast cancer biopsies, collected from 198 patients, to assess tumor-infiltrating lymphocytes (TILs), transcriptomic profiles, and TME composition. Diagnostic biopsy and surgical on-treatment tumor specimens were collected; Ki67, ERα, PR, and HER2 expression were measured using automated quantitative analysis (AQUA). Tumors were categorized as estrogen deprivation-sensitive (ED-S) or -resistant (ED-R) based on the natural log (ln) of the Ki67 score (ln ≤1.0 or ≤2.7% Ki67+ cells vs. ln ≥2.0 or ≥7.4%, respectively) in the on-treatment (surgical) biopsy. Scoring of stromal (s)TILs, using hematoxylin and eosin staining of on-treatment specimens, revealed that sTILs were elevated in ED-R compared to ED-S tumors (p<0.0001). We next constructed tissue microarrays (TMAs) of on-treatment tumor sections and performed cyclic immunofluorescence (CyCIF) with 38 antibodies, including markers of hormone receptors, immune cells, signaling pathways, proliferation, DAPI (nuclei), and others. We then segmented single cells from each tumor core and designated them as immune, cancer, or stromal cells based on expression of a set of markers. Briefly, cells that stained strongly for CD45 (leukocyte marker), and/or CD4 (T lymphocyte marker), or CD68 (macrophage marker) were considered immune cells. CD45/CD4/CD68-negative cells were categorized as tumor, if E-cadherin and/or cytokeratin-positive, or stromal cells, if -negative. To investigate the TME composition, we next assessed cell specific spatial enrichment by quantifying the expression of immune markers in the area immediately adjacent to each tumor cell. Relative to ED-S, ED-R samples exhibited higher CD45+ cells (p<0.0001) and higher CD8+ T cells (p=0.0329), while CD4+ T cells showed no difference. Conversely, immune-suppressive T-reg (CD4+FOXP3+) cells were enriched in the ED-S samples (p=0.0004). In addition, PD1, a marker for T cell exhaustion, was higher in the ED-S group (p=0.0004), as were CD68+ cells (p<0.0001). To confirm and expand upon these findings, RNA-sequencing was performed on the on-treatment tumor sections. Gene set enrichment analysis of hallmark gene signatures revealed that immune-related gene sets, such as “IFNα response”, “IFNɣ response”, “allograft rejection”, and “inflammatory response” were enriched in ED-R vs. ED-S tumors. In summary, our study shows that activated anti-tumor immune cells are enriched in the TME of ER+ breast tumors resistant to estrogen deprivation, whereas ED-sensitive tumors show a more immunosuppressed or immune cold milieu. These data suggest a potential causal link between antiestrogen treatment and modulation of antitumor immunity in ER+ breast cancers. Citation Format: Fabiana Napolitano, Dhivya R. Sudhan, Yunguan Wang, Paula I. González-Ericsson, Luigi Formisano, Kyung-Min Lee, Chang-Ching Lin, María Rosario Chica-Parrado, Hongli Ma, Nathaniel Evans, Alberto Servetto, Saurabh Mendiratta, Spencer Barnes, Yisheng V. Fang, Justin M. Balko, Gordon B. Mills, Marilyne Labrie, Ariella B. Hanker, Carlos L. Arteaga. Immune cells infiltration and activation are higher in breast cancers resistant to antiestrogen therapy [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2023; Part 1 (Regular and Invited Abstracts); 2023 Apr 14-19; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2023;83(7_Suppl):Abstract nr 3445.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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