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Enregistrement W4362554198 · doi:10.9778/cmajo.20220045

Canadian SARS-CoV-2 serological survey using antenatal serum samples: a retrospective seroprevalence study

2023· article· en· W4362554198 sur OpenAlexaffvenueabout
Andrea Atkinson, Arianne Albert, Elisabeth McClymont, Janice Andrade, Lori Beach, Shelly Bolotin, Isabelle Boucoiran, Jared Bullard, Carmen Charlton, Joan Crane, Shelley Dougan, Jean‐Claude Forest, Greg J. German, Yves Giguère, Gabriel Girouard, Catherine Hankins, Mel Krajden, Amanda Lang, Paul N. Levett, Jessica Minion, Cory Neudorf, Vanessa Poliquin, Jason L. Robinson, Heather Scott, Derek R. Stein, Vanessa Tran, George Zahariadis, Hong Zhou, Deborah Money

Notice bibliographique

RevueCMAJ Open · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Impact on Reproduction
Établissements canadiensPublic Health Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSeroprevalenceSerologySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)VirologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Medicine2019-20 coronavirus outbreakRetrospective cohort studyImmunologyAntibodyInternal medicineInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Insufficient data on the rate and distribution of SARS-CoV-2 infection in Canada has presented a substantial challenge to the public health response to the COVID-19 pandemic. Our objective was to assess SARS-CoV-2 seroprevalence in a representative sample of pregnant people throughout Canada, across multiple time points over 2 years of the pandemic, to describe the seroprevalence and show the ability of this process to provide prevalence estimates. METHODS: This Canadian retrospective serological surveillance study used existing serological prenatal samples across 10 provinces over multiple time periods: Feb. 3-21, 2020; Aug. 24-Sept. 11, 2020; Nov. 16-Dec. 4, 2020; Nov. 15-Dec. 3, 2021; and results from the province of British Columbia during a period in which the SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) variant was predominant, from Nov. 15, 2021, to June 11, 2022. Age and postal code administrative data allowed for comparison with concurrent polymerase chain reactivity (PCR)-positive results collected by Statistics Canada and the Canadian Surveillance of COVID-19 in Pregnancy (CANCOVID-Preg) project. RESULTS: Seropositivity in antenatal serum as early as February 2020 indicates SARS-CoV-2 transmission before the World Health Organization's declaration of the pandemic. Seroprevalence in our sample of pregnant people was 1.84 to 8.90 times higher than the recorded concurrent PCR-positive prevalence recorded among females aged 20-49 years in November-December 2020. Overall seropositivity in our sample of pregnant people was low at the end of 2020, increasing to 15% in 1 province by the end of 2021. Seroprevalence among pregnant people in BC during the Omicron period increased from 5.8% to 43% from November 2021 to June 2022. INTERPRETATION: These results indicate widespread vulnerability to SARS-CoV-2 infection before vaccine availability in Canada. During the time periods sampled, public health tracking systems were under-reporting infections, and seroprevalence results during the Omicron period indicate extensive community spread of SARS-CoV-2 infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: oui
Observationnellow
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: oui
Observationnelmedium
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,118
Score d'incertitude au seuil0,829

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,227
Tête enseignante GPT0,433
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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