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Enregistrement W4362575716 · doi:10.21203/rs.3.rs-2753591/v1

A non-destructive method to detect pathogens in bumble bees for conservation research

2023· preprint· en· W4362575716 sur OpenAlexafffund
Mathilde L. Tissier, Cole Blair, Sarah MacKell, Lynn S. Adler, J. Scott MacIvor, Patrick Bergeron, Carolyn Callaghan, Geneviève Labrie, Sheila R. Colla, Valérie Fournier

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensUniversité LavalCanadian Wildlife FederationThe Scarborough HospitalYork UniversityUniversity of TorontoBishop's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaLiber Ero FoundationMitacsMinistère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Mots-clésBiologyEndangered speciesThreatened speciesHoney BeesEcologyHoney beeBombus terrestrisZoologyPollinatorPollinationHabitat

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Wild bees are declining worldwide, and many species are now threatened with extinction. Decline is caused by a combination of threats, including disease spillover from managed bees that reduces health of wild bees. An increasing number of studies thus aim to characterize bee health. The common approaches, however, require sacrificing tens to hundreds of individual bees per site or species, with reports of several thousand individuals collected per study. Considering the widespread need to assess bee health, this sampling approach is not sustainable, especially for endangered populations or species. Here, we propose a non-destructive method to assess parasite loads of wild-caught bumble bees. The standard protocol consists of net-capturing individual bumble bees and placing them in a 10 cm (diameter) petri dish to collect faeces. Although this approach is frequently used in laboratory settings, it is not in the field, because of the low success in collecting faeces. Placing bumble bees in a previously refrigerated cooler, we significantly improved faecal collection in the field from 76% with the standard protocol to 86% with the cooler protocol. We also successfully identified spores and cells of two common gut parasites Crithidia spp. and Vairimorpha spp. in faecal samples. The efficacy of the cooler protocol, combined to the low-cost and widespread availability of the equipment should promote its use in field studies. Implication for insect conservation: As there are calls to reduce destructive sampling methods in bee research, using the updated cooler protocol will contribute to achieving this goal. This opens future avenues of combining this non-destructive approach to assess bee health with molecular tools.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,407
Tête enseignante GPT0,465
Écart entre enseignants0,057 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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