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Enregistrement W4362577243 · doi:10.22215/etd/2022-15440

Histone Arginine Methylation in the Freeze-tolerant Wood Frog, Rana sylvatica

2022· dissertation· en· W4362577243 sur OpenAlexaff
Mairelys Naranjo Vera

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHistone methyltransferaseHistone methylationHistoneMethylationBiologyArginineMethyltransferaseCell biologyBiochemistryMolecular biologyDNA methylationGeneGene expressionAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The wood frog, Rana sylvatica, is well known for its freeze tolerance ability.To endure winter, frozen frogs switch to a hypometabolic state via transcriptional regulation.Histone methylation is known to play a crucial role in regulating gene transcription.However, histone arginine methylation or demethylation has not previously been studied in the context of freeze tolerance.This thesis presents the first characterization of arginine methylation in a freeze tolerant vertebrate.Overall, levels of protein arginine methyltransferases (PRMTs) and methylated histone residues showed differential regulation over the freeze/thaw-cycle in wood frog liver.All PRMTs and downstream targets showed no changes during freezing, but protein levels of targets associated with transcription activation were elevated during thaw in skeletal muscle.Differential levels of histone demethylases were found in both tissues among the experimental conditions.These results indicate a role for histone methylation in supporting metabolic rate depression and tissue homeostasis during freezing. JMJD6 Jumonji domain-containing protein 6 KCl Potassium chloride KDM1A/LSD1Lysine demethylase 1A/ Lysine-specific demethylase 1 KDM4A Lysine demethylase 4A KDM4B Lysine Demethylase 4B KDM4D Lysine Demethylase 4D KDM4E Lysine Demethylase 4E KDM5B Lysine Demethylase 5B KDM5C Lysine Demethylase 5C KDM7C/PHF2 Lysine Demethylase 7C/PHD finger protein KDMs Lysine demethylases

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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