Histone Arginine Methylation in the Freeze-tolerant Wood Frog, Rana sylvatica
Notice bibliographique
Résumé
The wood frog, Rana sylvatica, is well known for its freeze tolerance ability.To endure winter, frozen frogs switch to a hypometabolic state via transcriptional regulation.Histone methylation is known to play a crucial role in regulating gene transcription.However, histone arginine methylation or demethylation has not previously been studied in the context of freeze tolerance.This thesis presents the first characterization of arginine methylation in a freeze tolerant vertebrate.Overall, levels of protein arginine methyltransferases (PRMTs) and methylated histone residues showed differential regulation over the freeze/thaw-cycle in wood frog liver.All PRMTs and downstream targets showed no changes during freezing, but protein levels of targets associated with transcription activation were elevated during thaw in skeletal muscle.Differential levels of histone demethylases were found in both tissues among the experimental conditions.These results indicate a role for histone methylation in supporting metabolic rate depression and tissue homeostasis during freezing. JMJD6 Jumonji domain-containing protein 6 KCl Potassium chloride KDM1A/LSD1Lysine demethylase 1A/ Lysine-specific demethylase 1 KDM4A Lysine demethylase 4A KDM4B Lysine Demethylase 4B KDM4D Lysine Demethylase 4D KDM4E Lysine Demethylase 4E KDM5B Lysine Demethylase 5B KDM5C Lysine Demethylase 5C KDM7C/PHF2 Lysine Demethylase 7C/PHD finger protein KDMs Lysine demethylases
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».