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Enregistrement W4362585774 · doi:10.1101/2023.03.30.23287941

Impact of Case and Control Selection on Training AI Screening of Cardiac Amyloidosis

2023· preprint· en· W4362585774 sur OpenAlexaff
Amey Vrudhula, L. Stern, Paul Cheng, Piero Ricchiuto, Chathuri Daluwatte, Ronald Witteles, Jignesh Patel, David Ouyang

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAmyloidosis: Diagnosis, Treatment, Outcomes
Établissements canadiensArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesCedars-Sinai Medical Center
Mots-clésGeneralizability theoryCohortMedicinePopulationAmyloidosisFeature selectionInternal medicineMachine learningStatisticsComputer scienceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Recent studies suggest that cardiac amyloidosis (CA) is significantly underdiagnosed. For rare diseases like CA, the optimal selection of cases and controls for artificial intelligence (AI) model training is unknown and can significantly impact model performance. Objectives This study evaluates the performance of ECG waveform-based AI models for CA screening and assesses impact of different criteria for defining cases and controls. Methods Models were trained using different criteria for defining cases and controls including amyloidosis by ICD 9/10 code, cardiac amyloidosis, patients seen in CA clinic). The models were then tested on test cohorts with identical selection criteria as well as population-prevalence cohorts. Results In matched held out test datasets, different model AUCs ranged from 0.660 to 0.898. However, these same algorithms exhibited variable generalizability when tested on a population cohort, with AUCs dropping to 0.467 to 0.880. More stringent case definitions during training result in higher AUCs on the similarly constructed test cohort; however representative population controls matched for age and sex resulted in the best population screening performance. Conclusions AUC in isolation is insufficient to evaluate the performance of a deep learning algorithm, and the evaluation in the most clinically meaningful population is key. Models designed for disease screening are best with matched population controls and performed similarly irrespective of case definitions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,045
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,093
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,239

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0450,093
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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