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Enregistrement W4362593599 · doi:10.1158/1538-7445.am2023-4670

Abstract 4670: True bench-to-bedside science: An international pilot study modeling hard-to-cure pediatric cancers to prioritize therapeutic intervention

2023· article· en· W4362593599 sur OpenAlexaffabout
Nadine Azzam, Nicole Melong, Lissandra Tuzi, Lisa Pinto, Jamie I. Fletcher, Alvin Kamili, Biljana Dumevska, Loretta M. S. Lau, Jennifer A. Chan, Donna L. Senger, Stephanie A. Grover, Michelle Haber, David Malkin, Jason N. Berman

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenJewish General HospitalChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCancerOncologyZebrafishInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract There has been dramatic improvement in treatment outcomes for many pediatric cancers over the last three decades. However, for the 20% of young people with relapsed or refractory cancer, the prognosis remains grim. Canada’s PRecision Oncology For Young peopLE (PROFYLE) and Australia’s Zero Childhood Cancer (ZERO) programs, leverage nation-wide scientific and clinical oncology expertise to provide personalized precision medicine to children, adolescent and young adult (CAYA) cancer patients who lack treatment options. Beyond improving the lives of young cancer patients nationally, PROFYLE and ZERO have partnered to create an international pipeline for knowledge sharing and sample acquisition. A key component of both programs is the use of mice for patient-derived xenografts (PDXs). However, long lead times for mouse PDX generation make the timely return of preclinical drug response data challenging. PROFYLE has uniquely incorporated zebrafish larval xenografts, which have the potential to provide comparable information in a clinically actionable timeframe. In a pilot study, we compared retrospective matched ZERO patient and mouse PDX therapeutic response data with prospective zebrafish larval PDX data as a proof-of-principle that drug efficacy signals were maintained across model systems. Three ZERO avatars: high-risk neuroblastoma, Ewing’s sarcoma, and anaplastic large cell lymphoma were shipped from Australia to Canada and transplanted into 48h casper zebrafish. Following dose optimization, zebrafish PDXs were treated with targeted single and combination drug treatments by immersion therapy. Strikingly, in as little time as a week, cell proliferation rates and drug responses to single agents and combinatorial therapy in zebrafish PDXs recapitulated mouse and patient data. To expand on this pilot project, we tested additional patient samples, including multiple subtypes of sarcomas, T-cell acute lymphoblastic leukemia and an embryonal tumor with multilayered rosettes. Results further validated the practical utility of the zebrafish larval PDX model and in fact provided drug response data when mouse PDX data were unavailable. This study demonstrates the robustness and feasibility of the zebrafish larval PDX model as a preclinical tool for personalized precision therapeutic decision-making and highlights the value of international collaboration in improving outcomes of rare childhood cancers. Citation Format: Nadine Azzam, Nicole Melong, Lissandra Tuzi, Lisa Pinto, Jamie I. Fletcher, Alvin Kamili, Biljana Dumevska, Loretta Lau, Jennifer A. Chan, Donna L. Senger, Stephanie A. Grover, Michelle Haber, David Malkin, Jason N. Berman. True bench-to-bedside science: An international pilot study modeling hard-to-cure pediatric cancers to prioritize therapeutic intervention. [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2023; Part 1 (Regular and Invited Abstracts); 2023 Apr 14-19; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2023;83(7_Suppl):Abstract nr 4670.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,138
Tête enseignante GPT0,483
Écart entre enseignants0,345 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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