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Enregistrement W4362602338 · doi:10.1021/acs.jcim.3c00142

<i>WhereWulff</i>: A Semiautonomous Workflow for Systematic Catalyst Surface Reactivity under Reaction Conditions

2023· article· en· W4362602338 sur OpenAlexfundno aff
Rohan Yuri Sanspeur, Javier Heras‐Domingo, John R. Kitchin, Zachary W. Ulissi

Notice bibliographique

RevueJournal of Chemical Information and Modeling · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueMachine Learning in Materials Science
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesLawrence Berkeley National LaboratoryOffice of ScienceArmy Research OfficeNational Research Council CanadaNational Energy Research Scientific Computing CenterU.S. Department of Energy
Mots-clésWorkflowComputer scienceConstraint (computer-aided design)Density functional theoryStability (learning theory)ChemistryComputational scienceMaterials scienceComputational chemistryDatabaseGeometryMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide This paper introduces WhereWulff, a semiautonomous workflow for modeling the reactivity of catalyst surfaces. The workflow begins with a bulk optimization task that takes an initial bulk structure and returns the optimized bulk geometry and magnetic state, including stability under reaction conditions. The stable bulk structure is the input to a surface chemistry task that enumerates surfaces up to a user-specified maximum Miller index, computes relaxed surface energies for those surfaces, and then prioritizes those for subsequent adsorption energy calculations based on their contribution to the Wulff construction shape. The workflow handles computational resource constraints such as limited wall-time as well as automated job submission and analysis. We illustrate the workflow for oxygen evolution reaction (OER) intermediates on two double perovskites. WhereWulff nearly halved the number of Density Functional Theory (DFT) calculations from ∼240 to ∼132 by prioritizing terminations, up to a maximum Miller index of 1, based on surface stability. Additionally, it automatically handled the 180 additional resubmission jobs required to successfully converge 120+ atoms systems under a 48-h wall-time cluster constraint. There are four main use cases that we envision for WhereWulff: (1) as a first-principles source of truth to validate and update a closed-loop self-sustaining materials discovery pipeline, (2) as a data generation tool, (3) as an educational tool, allowing users (e.g., experimentalists) unfamiliar with OER modeling to probe materials they might be interested in before doing further in-domain analyses, (4) and finally, as a starting point for users to extend with reactions other than the OER, as part of a collaborative software community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil0,357

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1070,060

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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