MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4362608416 · doi:10.3390/jof9040445

A Correlation between 3′-UTR of OXA1 Gene and Yeast Mitochondrial Translation

2023· article· en· W4362608416 sur OpenAlexafffund
Maryam Hajikarimlou, Mohsen Hooshyar, Noor Sunba, Nazila Nazemof, Mohamed Taha Moutaoufik, Sadhena Phanse, Kamaleldin B. Said, Mohan Babu, Martin Holčı́k, Bahram Samanfar, Myron L. Smith, Ashkan Golshani

Notice bibliographique

RevueJournal of Fungi · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Interactions Research
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of ReginaCarleton University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyMitochondrionFive prime untranslated regionUntranslated regionTranslation (biology)Mitochondrial DNAThree prime untranslated regionMessenger RNAGeneticsMT-RNR1GeneCell biologyMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondria possess their own DNA (mtDNA) and are capable of carrying out their transcription and translation. Although protein synthesis can take place in mitochondria, the majority of the proteins in mitochondria have nuclear origin. 3′ and 5′ untranslated regions of mRNAs (3′-UTR and 5′-UTR, respectively) are thought to play key roles in directing and regulating the activity of mitochondria mRNAs. Here we investigate the association between the presence of 3′-UTR from OXA1 gene on a prokaryotic reporter mRNA and mitochondrial translation in yeast. OXA1 is a nuclear gene that codes for mitochondrial inner membrane insertion protein and its 3′-UTR is shown to direct its mRNA toward mitochondria. It is not clear, however, if this mRNA may also be translated by mitochondria. In the current study, using a β-galactosidase reporter gene, we provide genetic evidence for a correlation between the presence of 3′-UTR of OXA1 on an mRNA and mitochondrial translation in yeast.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,154
Score d'incertitude au seuil0,145

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of FungiMême sujetPlant and Fungal Interactions ResearchTravaux en français237 207