Enregistrement W4362658965 · doi:10.1016/j.scitotenv.2023.163292

An improved method for determining frequency of multiple variants of SARS-CoV-2 in wastewater using qPCR assays

2023· article· en· W4362658965 sur OpenAlexafffund

Meghan Fuzzen, Nathanael B.J. Harper, Hadi A. Dhiyebi, Nivetha Srikanthan, Samina Hayat, Leslie M. Bragg, Shelley Peterson, Minqing Ivy Yang, Jianxian Sun, Elizabeth A. Edwards, John P. Giesy, Chand S. Mangat, Tyson E. Graber, Robert Delatolla, Mark R. Servos

Notice bibliographique

RevueThe Science of The Total Environment · 2023

Typearticle

Langueen

DomaineMedicine

ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing

Établissements canadiensUniversity of OttawaChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of SaskatchewanPublic Health Agency of CanadaUniversity of TorontoUniversity of Waterloo

Organismes subventionnairesGlobal Water FuturesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistère de l’Environnement, de la Protection de la nature et des ParcsCanada Research ChairsPublic Health Agency of Canada

Mots-clésWastewaterAmpliconMultiplexAmplicon sequencingBiologyPolymerase chain reactionSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Real-time polymerase chain reactionSewage treatmentCoronavirus disease 2019 (COVID-19)VirologyComputational biologyGeneGeneticsEnvironmental scienceEnvironmental engineeringMedicine16S ribosomal RNAInfectious disease (medical specialty)

DOI10.1016/j.scitotenv.2023.163292

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004

score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005

Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated

Catégories candidatesaucune

Catégories consensuellesaucune

DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune

Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)

GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes

Score de désaccord entre enseignants0,004

Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

Catégorie	Codex	Gemma
Métarecherche	0,004	0,005
Méta-épidémiologie (sens strict)	0,003	0,002
Méta-épidémiologie (sens large)	0,002	0,002
Bibliométrie	0,003	0,001
Études des sciences et des technologies	0,001	0,001
Communication savante	0,001	0,001
Science ouverte	0,002	0,001
Intégrité de la recherche	0,002	0,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)	0,002	0,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074

Tête enseignante GPT0,334

Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail

Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)

Domainenon disponible

GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13

Publié2023

Routes d'admission2

Résumé présentnon

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