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Enregistrement W4362658965 · doi:10.1016/j.scitotenv.2023.163292

An improved method for determining frequency of multiple variants of SARS-CoV-2 in wastewater using qPCR assays

2023· article· en· W4362658965 sur OpenAlexafffund
Meghan Fuzzen, Nathanael B.J. Harper, Hadi A. Dhiyebi, Nivetha Srikanthan, Samina Hayat, Leslie M. Bragg, Shelley Peterson, Minqing Ivy Yang, Jianxian Sun, Elizabeth A. Edwards, John P. Giesy, Chand S. Mangat, Tyson E. Graber, Robert Delatolla, Mark R. Servos

Notice bibliographique

RevueThe Science of The Total Environment · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensUniversity of OttawaChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of SaskatchewanPublic Health Agency of CanadaUniversity of TorontoUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesGlobal Water FuturesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistère de l’Environnement, de la Protection de la nature et des ParcsCanada Research ChairsPublic Health Agency of Canada
Mots-clésWastewaterAmpliconMultiplexAmplicon sequencingBiologyPolymerase chain reactionSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Real-time polymerase chain reactionSewage treatmentCoronavirus disease 2019 (COVID-19)VirologyComputational biologyGeneGeneticsEnvironmental scienceEnvironmental engineeringMedicine16S ribosomal RNAInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,309
Score d'incertitude au seuil0,245

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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