The Haemonchus contortus LGC-39 subunit is a novel subtype of an acetylcholine-gated chloride channel
Notice bibliographique
Résumé
The nematode genome exhibits a vast array of Cys-loop receptors that are activated by a diverse set of neurotransmitters and anthelmintic drugs such as ivermectin and levamisole. While many Cys-loop receptors have been functionally and pharmacologically characterized, there remains a large subset of orphan receptors where the agonist remains unknown. We have identified an orphan Cys-loop receptor, LGC-39, from the parasitic nematode Haemonchus contortus that is a novel type of cholinergic-sensitive ligand-gated chloride channel. This receptor groups outside of the acetylcholine-gated chloride channel family, in the previously named GGR-1 (GABA/Glycine Receptor-1) group of Cys-loop receptors. We found that LGC-39 forms a functional homomeric receptor when expressed in Xenopus laevis oocytes and is activated by several cholinergic ligands including acetylcholine, methacholine and surprisingly, atropine with an EC50 for atropine on the low μM range. A homology model was generated which revealed some key features of the LGC-39 ligand-binding pocket that may explain some of the elements important for atropine recognition of the LGC-39 receptor. Overall these results suggest that the GGR-1 family (now called LGC-57) of Cys-loop receptors includes novel acetylcholine-gated chloride channel subtypes and may represent important future drug targets.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».