A rapid assessment of non-native fish distributions in two English river basins using environmental DNA
Notice bibliographique
Résumé
Environmental DNA (eDNA) surveys are increasingly used to inform management decisions for non-native species, for example, by detecting the presence and plotting distributions of species that may be in too low abundance for easy detection by conventional means. A recently-developed nested PCR protocol was used to assess the distributions of three non-native fish species in two river basins of southern England (River Test, Hampshire; River Ouse, Sussex). These river basins were known to contain three non-native fishes, either in the recent past or currently: two invasive small-bodied fish species (topmouth gudgeon Pseudorasbora parva, sunbleak Leucaspius delineatus), as well as a currently non-invasive species predicted to become invasive under future climate conditions, pumpkinseed Lepomis gibbosus. Water samples were collected at locations from headwater streams to estuary. Pumpkinseed and sunbleak were both detected downstream of an angling venue in the Sussex Ouse catchment known to contain those species, with an upstream expansion of sunbleak suggested by the detection of eDNA at a few upstream locations. Neither sunbleak nor topmouth gudgeon was detected in water samples from the River Test catchment, suggesting that neither species has persistent populations in that river catchment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».